Dicer

DICER1
Estructures disponibles PDB Cerca ortòloga: PDBe RCSB Llista de codis id de PDB 2EB1, 4NGB, 4NGC, 4NGD, 4NGF, 4NGG, 4NH3, 4NH5, 4NH6, 4NHA, 4WYQ
Identificadors
Àlies	DICER1, DCR1, Dicer, Dicer1e, HERNA, MNG1, RMSE2, K12H4.8-LIKE, dicer 1, ribonuclease III, GLOW
IDs externes	OMIM: 606241 MGI: 2177178 HomoloGene: 13251 GeneCards: DICER1
Localització del gen (ratolí) Cr. Cromosoma 12 (ratolí)[1] Banda 12 E|12 54.83 cM Inici 104,654,001 bp[1] Fi 104,718,211 bp[1]
Patró d'expressió d'ARN Bgee Humà Ratolí (ortòleg) Més explicacions caput epididymis nervi òptic os esponjós corpus epididymis visceral pleura cavitat oral parietal pleura inferior ganglion of vagus nerve mugró cos callós Més explicacions secondary oocyte medullary collecting duct corpuscle renal abdominal wall primitive streak maxillary prominence somita superior cervical ganglion eminència ganglionar fol·licle pilós Més dades d'expressió de referència BioGPS n/a
Ontologia genètica Funció molecular unió de nucleòtids helicase activity protein domain specific binding pre-miRNA binding metal ion binding endoribonuclease activity endoribonuclease activity, producing 5'-phosphomonoesters unió proteica siRNA binding RNA binding nuclease activity double-stranded RNA binding endonuclease activity activitat hidrolasa Unió d'ATP ribonuclease III activity DNA binding deoxyribonuclease I activity Component cel·lular citoplasma citosol Complex de silenciament induït per ARN growth cone ARC complex RISC-loading complex axó Dendrita nucli cel·lular endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment exosoma extracel·lular Procés biològic neuron projection morphogenesis RNA processing negative regulation of transcription by RNA polymerase II peripheral nervous system myelin formation pre-miRNA processing positive regulation of myelination nerve development RNA phosphodiester bond hydrolysis, endonucleolytic positive regulation of Schwann cell differentiation negative regulation of Schwann cell proliferation production of miRNAs involved in gene silencing by miRNA miRNA metabolic process production of siRNA involved in RNA interference silenciament gènic apoptotic DNA fragmentation negative regulation of tumor necrosis factor production NIK/NF-kappaB signaling negative regulation of gene expression tube formation Fonts:Amigo / QuickGO
Ortòlegs Espècies Humà Ratolí Entrez 23405 192119 Ensembl ENSG00000100697 ENSMUSG00000041415 UniProt Q9UPY3 Q8R418 SeqRef (ARNm) NM_001195573 NM_001271282 NM_001291628 NM_030621 NM_177438 NM_148948 SeqRef (proteïna) NP_001182502 NP_001258211 NP_001278557 NP_085124 NP_803187 NP_683750 Localització (UCSC) n/a Chr 12: 104.65 – 104.72 Mb Cerca a PubMed [2] [3]
Wikidata
Veure/Editar Humà Veure/Editar Ratolí

Dicer és una ribonucleasa membre de la família de les ARNasa III. És una gran proteïna (>200 kD) monomèrica present en el citoplasma cel·lular. Dicer catalitza el primer pas del mecanisme de RNAi: converteix ARN doble banda (ARNdb o dsRNA) i premicroARN (pre-miARN) en fragments d'ARN d'interferència petits anomenats ARNip (siRNAs i miRNAs) de 20-25 nucleòtids, amb dues bases lliures als extrems 3' hidroxil i un extrem 5' fosfat.

El nom Dicer fou donat per Emily Bernstein, qui fou la primera a demostrar l'activitat catalítica d'ARNdb de l'enzima.

Les enzimes Dicer contenen:

• un domini ATPasa/ARN helicasa a l'extrem N-terminal
• un domini DUF283 de funció desconeguda
• un domini PAZ, responsable del reconeixement dels nucleòtids lliures a l'extrem 3'
• dos dominis catalítics ARNasa III (RIIIa i RIIIb) que constitueixen el centre actiu
• un domini dsRBD (en anglès: double strand RNA binding domain) a l'extrem C-terminal

Cadascun dels dominis ARNasa talla una cadena d'ARN de manera polaritzada: el domini RIIIb talla la cadena ascendent del dsRNA, que conté el 5' fosfat, mentre que el domini RIIIa talla la cadena descendent, que conté l'extrem 3' OH. El domini RIIIa mesura la distància al lloc de tall del dsRNA, potser amb l'ajuda del domini PAZ. Per aquest motiu, el dsRNA es talla a una distància aproximada de 20 parells de bases contades des de l'extrem de la molècula: l'hèlix entre el domini PAZ i el domini RIIIa mesura 65 àngstroms, que corresponen a dues voltes d'hèlix de dsRNA.