HDAC4

HDAC4
Domaine catalytique Hdac4. PDB2vqj
Structures disponibles
PDBRecherche d'orthologue: PDBe RCSB
Identifiants PDB

2H8N, 2O94, 2VQJ, 2VQM, 2VQO, 2VQQ, 2VQV, 2VQW, 3UXG, 3UZD, 3V31, 4CBT, 4CBY, 5A2S

Identifiants
AliasesHDAC4
IDs externesOMIM: 605314 MGI: 3036234 HomoloGene: 55946 GeneCards: HDAC4
Position du gène (Homme)
Chromosome 2 humain
Chr.Chromosome 2 humain[1]
Chromosome 2 humain
Localisation génomique pour HDAC4
Localisation génomique pour HDAC4
Locus2q37.3Début239,048,168 bp[1]
Fin239,401,654 bp[1]
Position du gène (Souris)
Chromosome 1 (souris)
Chr.Chromosome 1 (souris)[2]
Chromosome 1 (souris)
Localisation génomique pour HDAC4
Localisation génomique pour HDAC4
Locus1|1 DDébut91,856,501 bp[2]
Fin92,123,421 bp[2]
Expression génétique
Bgee
HumainSouris (orthologue)
Fortement exprimé dans
  • nerf sural

  • muscle glutéal

  • muscle gastrocnémien

  • muscle tibial antérieur

  • muscle de la cuisse

  • muscle layer of sigmoid colon

  • cellule endothéliale

  • muscle deltoïde

  • Skeletal muscle tissue of biceps brachii

  • sang
Fortement exprimé dans
  • otic vesicle

  • granulocyte

  • gastrula

  • Rostral migratory stream

  • dentate gyrus of hippocampal formation granule cell

  • muscle de la cuisse

  • lèvre

  • septum interventriculaire

  • tissu musculaire

  • skeletal muscle tissue
Plus de données d'expression de référence
BioGPS
Plus de données d'expression de référence
Gene Ontology
Fonction moléculaire
  • NAD-dependent histone deacetylase activity (H3-K14 specific)
  • sequence-specific DNA binding
  • liaison ADN
  • transcription corepressor activity
  • histone deacetylase activity
  • zinc ion binding
  • transcription factor binding
  • liaison d'histone déacétylase
  • potassium ion binding
  • liaison de chromatine
  • liaison ion métal
  • liaison protéique
  • protein kinase binding
  • activité hydrolase
  • protein deacetylase activity
  • identical protein binding
  • promoter-specific chromatin binding
  • RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding
  • SUMO transferase activity
Composant cellulaire
  • cytoplasme
  • histone deacetylase complex
  • Plaque motrice
  • transcription repressor complex
  • Sarcomère
  • Z disc
  • A band
  • actomyosin
  • noyau
  • cytosol
  • nucléoplasme
  • complexe macromoléculaire
Processus biologique
  • positive regulation of reactive oxygen species biosynthetic process
  • histone H3 deacetylation
  • skeletal system development
  • Remodelage de la chromatine
  • peptidyl-lysine deacetylation
  • regulation of cardiac muscle contraction by calcium ion signaling
  • negative regulation of glycolytic process
  • response to interleukin-1
  • regulation of transcription, DNA-templated
  • regulation of gene expression, epigenetic
  • cellular response to tumor necrosis factor
  • positive regulation of DNA-binding transcription factor activity
  • negative regulation of transcription by RNA polymerase II
  • positive regulation of protein sumoylation
  • negative regulation of DNA-binding transcription factor activity
  • negative regulation of osteoblast differentiation
  • transcription, DNA-templated
  • neurodéveloppement
  • regulation of striated muscle cell differentiation
  • régulation positive de la transcription dépendante de l'ADN
  • positive regulation of smooth muscle cell migration
  • B cell activation
  • histone H4 deacetylation
  • cellular response to mechanical stimulus
  • positive regulation of neuron apoptotic process
  • cardiac muscle hypertrophy in response to stress
  • positive regulation of cell population proliferation
  • negative regulation of myotube differentiation
  • response to denervation involved in regulation of muscle adaptation
  • regulation of skeletal muscle fiber development
  • osteoblast development
  • B cell differentiation
  • cellular response to parathyroid hormone stimulus
  • réponse inflammatoire
  • positive regulation of lamellipodium assembly
  • regulation of protein binding
  • negative regulation of transcription, DNA-templated
  • histone deacetylation
  • positive regulation of transcription by RNA polymerase II
  • negative regulation of cell population proliferation
  • positive regulation of smooth muscle cell proliferation
  • organisation de la chromatine
  • negative regulation of pri-miRNA transcription by RNA polymerase II
  • protein deacetylation
  • Sumoylation
  • positive regulation of male mating behavior
Sources:Amigo / QuickGO
Orthologues
EspècesHommeSouris
Entrez

9759

208727

Ensembl

ENSG00000068024

ENSMUSG00000026313

UniProt

P56524

Q6NZM9

RefSeq (mRNA)

NM_006037
NM_001378414
NM_001378415
NM_001378416
NM_001378417

NM_207225

RefSeq (protéine)

NP_006028
NP_001365343
NP_001365344
NP_001365345
NP_001365346

NP_997108

Localisation (UCSC)Chr 2: 239.05 – 239.4 MbChr 1: 91.86 – 92.12 Mb
Publication PubMed[3][4]
Wikidata
Voir/Editer HumainVoir/Editer Souris

L'HDAC4 est une histone désacétylase. Son gène est le HDAC4 situé sur le chromosome 2 humain.

Rôles

Elle appartient à la classe II des histones désacétylases.

La protéine est phophorylée par le CaMKII qui en modifie l'activité[5], entraînant par exemple une hypertrophie des cardiomyocytes[6]. Elle contrôle également la prolifération et la migration des cellules musculaires lisses[7] contribuant ainsi à la genèse d'une hypertension artérielle[8].

Elle régule l'autophagie induite par l'angiotensine 2[9].

Notes et références

  1. a b et c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000068024 - Ensembl, May 2017
  2. a b et c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000026313 - Ensembl, May 2017
  3. « Publications PubMed pour l'Homme », sur National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine
  4. « Publications PubMed pour la Souris », sur National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine
  5. Dokmanovic M, Clarke C, Marks PA, Histone deacetylase inhibitors: overview and perspectives, Mol Cancer Res, 2007;5:981–989
  6. Backs J, Song K, Bezprozvannaya S, Chang S, Olson EN, CaM kinase II selectively signals to histone deacetylase 4 during cardiomyocyte hypertrophy, J Clin Invest, 2006;116:1853–1864
  7. Usui T, Morita T, Okada M, Yamawaki H, Histone deacetylase 4 controls neointimal hyperplasia via stimulating proliferation and migration of vascular smooth muscle cells, Hypertension, 2014;63:397
  8. Usui T, Okada M, Mizuno W, Oda M, Ide N, Morita T, Hara Y, Yamawaki H, HDAC4 mediates development of hypertension via vascular inflammation in spontaneous hypertensive rats, Am J Physiol-Heart C, 2012;302:H1894–H1904
  9. Yang D, Xiao C, Long F et al. HDAC4 regulates vascular inflammation via activation of autophagy, Cardiovascular Research, 2018;114:1016–1028
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