CDH12

Ідентифікатори

Символи

CDH12, CDHB, cadherin 12

Зовнішні ІД

OMIM: 600562 MGI: 109503 HomoloGene: 37873 GeneCards: CDH12

Онтологія гена
Молекулярна функція	• calcium ion binding • зв'язування з іоном металу • cytoskeletal protein binding • protein homodimerization activity • cadherin binding
Клітинна компонента	• integral component of membrane • клітинна мембрана • мембрана • cell surface • catenin complex
Біологічний процес	• адгезія клітин • adherens junction organization • homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules • cell-cell junction assembly • calcium-dependent cell-cell adhesion via plasma membrane cell adhesion molecules • cell-cell adhesion mediated by cadherin • cell-cell adhesion • GO:0000767 cell morphogenesis
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


1010


215654

Ensembl


ENSG00000154162


ENSMUSG00000040452

UniProt


P55289


Q5RJH3

RefSeq (мРНК)


NM_004061 NM_001317227 NM_001317228


NM_001008420

RefSeq (білок)

NP_001304156 NP_001304157 NP_004052 NP_001351033 NP_001351034
NP_001351035 NP_001351036 NP_001351037 NP_001351038


NP_001008420

Локус (UCSC)

Хр. 5: 21.75 – 22.85 Mb

Хр. 15: 20.45 – 21.59 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

CDH12 (англ. Cadherin 12) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 794 амінокислот, а молекулярна маса — 88 332^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MLTRNCLSLL	LWVLFDGGLL	TPLQPQPQQT	LATEPRENVI	HLPGQRSHFQ
RVKRGWVWNQ	FFVLEEYVGS	EPQYVGKLHS	DLDKGEGTVK	YTLSGDGAGT
VFTIDETTGD	IHAIRSLDRE	EKPFYTLRAQ	AVDIETRKPL	EPESEFIIKV
QDINDNEPKF	LDGPYVATVP	EMSPVGAYVL	QVKATDADDP	TYGNSARVVY
SILQGQPYFS	IDPKTGVIRT	ALPNMDREVK	EQYQVLIQAK	DMGGQLGGLA
GTTIVNITLT	DVNDNPPRFP	KSIFHLKVPE	SSPIGSAIGR	IRAVDPDFGQ
NAEIEYNIVP	GDGGNLFDIV	TDEDTQEGVI	KLKKPLDFET	KKAYTFKVEA
SNLHLDHRFH	SAGPFKDTAT	VKISVLDVDE	PPVFSKPLYT	MEVYEDTPVG
TIIGAVTAQD	LDVGSSAVRY	FIDWKSDGDS	YFTIDGNEGT	IATNELLDRE
STAQYNFSII	ASKVSNPLLT	SKVNILINVL	DVNEFPPEIS	VPYETAVCEN
AKPGQIIQIV	SAADRDLSPA	GQQFSFRLSP	EAAIKPNFTV	RDFRNNTAGI
ETRRNGYSRR	QQELYFLPVV	IEDSSYPVQS	STNTMTIRVC	RCDSDGTILS
CNVEAIFLPV	GLSTGALIAI	LLCIVILLAI	VVLYVALRRQ	KKKDTLMTSK
EDIRDNVIHY	DDEGGGEEDT	QAFDIGALRN	PKVIEENKIR	RDIKPDSLCL
PRQRPPMEDN	TDIRDFIHQR	LQENDVDPTA	PPYDSLATYA	YEGSGSVAES
LSSIDSLTTE	ADQDYDYLTD	WGPRFKVLAD	MFGEEESYNP	DKVT

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як клітинна адгезія, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Tanihara H., Sano K., Heimark R.L., St John T., Suzuki S. (1994). Cloning of five human cadherins clarifies characteristic features of cadherin extracellular domain and provides further evidence for two structurally different types of cadherin. Cell Adhes. Commun. 2: 15—26. PMID 7982033

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1751 (англ.) . Процитовано 31 серпня 2017.
↑ UniProt, P55289 (англ.) . Архів оригіналу за 10 січня 2018. Процитовано 31 серпня 2017.