CPSF7

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
3N9U

Ідентифікатори

Символи

CPSF7, CFIm59, FLJ12529, cleavage and polyadenylation specific factor 7

Зовнішні ІД

MGI: 1917826 HomoloGene: 11731 GeneCards: CPSF7

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding • nucleic acid binding • RNA binding
Клітинна компонента	• мембрана • клітинне ядро • нуклеоплазма • mRNA cleavage factor complex • цитоплазма • mRNA cleavage and polyadenylation specificity factor complex
Біологічний процес	• mRNA splicing, via spliceosome • termination of RNA polymerase II transcription • mRNA processing • mRNA 3'-end processing • protein tetramerization • protein heterotetramerization • pre-mRNA cleavage required for polyadenylation • mRNA alternative polyadenylation • messenger ribonucleoprotein complex assembly
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


79869


269061

Ensembl


ENSG00000149532


ENSMUSG00000034820

UniProt


Q8N684


Q8BTV2

RefSeq (мРНК)


NM_001136040 NM_001142565 NM_024811


NM_001164272 NM_172302 NM_001362450

RefSeq (білок)


NP_001129512 NP_001136037 NP_079087


NP_001157744 NP_758506 NP_001349379

Локус (UCSC)

Хр. 11: 61.4 – 61.43 Mb

Хр. 19: 10.5 – 10.53 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

CPSF7 (англ. Cleavage and polyadenylation specific factor 7) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 471 амінокислот, а молекулярна маса — 52 050^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSEGVDLIDI	YADEEFNQDP	EFNNTDQIDL	YDDVLTATSQ	PSDDRSSSTE
PPPPVRQEPS	PKPNNKTPAI	LYTYSGLRNR	RAAVYVGSFS	WWTTDQQLIQ
VIRSIGVYDV	VELKFAENRA	NGQSKGYAEV	VVASENSVHK	LLELLPGKVL
NGEKVDVRPA	TRQNLSQFEA	QARKRECVRV	PRGGIPPRAH	SRDSSDSADG
RATPSENLVP	SSARVDKPPS	VLPYFNRPPS	ALPLMGLPPP	PIPPPPPLSS
SFGVPPPPPG	IHYQHLMPPP	PRLPPHLAVP	PPGAIPPALH	LNPAFFPPPN
ATVGPPPDTY	MKASAPYNHH	GSRDSGPPPS	TVSEAEFEDI	MKRNRAISSS
AISKAVSGAS	AGDYSDAIET	LLTAIAVIKQ	SRVANDERCR	VLISSLKDCL
HGIEAKSYSV	GASGSSSRKR	HRSRERSPSR	SRESSRRHRD	LLHNEDRHDD
YFQERNREHE	RHRDRERDRH	H

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг мРНК, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Rueegsegger U., Beyer K., Keller W. (1996). Purification and characterization of human cleavage factor Im involved in the 3' end processing of messenger RNA precursors. J. Biol. Chem. 271: 6107—6113. PMID 8626397 DOI:10.1074/jbc.271.11.6107
Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:30098 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.
↑ UniProt, Q8N684 (англ.) . Архів оригіналу за 19 серпня 2016. Процитовано 8 вересня 2017.