DERL1

Ідентифікатори

Символи

DERL1, DER-1, DER1, derlin 1, derlin-1

Зовнішні ІД

OMIM: 608813 MGI: 1915069 HomoloGene: 11483 GeneCards: DERL1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding • MHC class I protein binding • ubiquitin protein ligase binding • protease binding • ubiquitin-specific protease binding • ATPase binding • signaling receptor activity
Клітинна компонента	• early endosome • VCP-NPL4-UFD1 AAA ATPase complex • integral component of endoplasmic reticulum membrane • Derlin-1-VIMP complex • integral component of membrane • late endosome • мембрана • Derlin-1 retrotranslocation complex • ендоплазматичний ретикулум • endoplasmic reticulum membrane • signal recognition particle receptor complex • signal recognition particle
Біологічний процес	• Unfolded Protein Response • Відповідь на незгорнуті білки • ERAD pathway • positive regulation of protein binding • protein transport • protein destabilization • retrograde protein transport, ER to cytosol • GO:0022415 viral process • ER-associated misfolded protein catabolic process • protein homooligomerization • positive regulation of protein ubiquitination • establishment of protein localization • ubiquitin-dependent ERAD pathway • response to unfolded protein • згортання білків • трансмембранний транспорт • Убіквітин-залежний протеоліз • GO:0015915 транспорт • proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


79139


67819

Ensembl


ENSG00000136986


ENSMUSG00000022365

UniProt


Q9BUN8


Q99J56

RefSeq (мРНК)


NM_001134671 NM_024295 NM_001330601 NM_001363963


NM_024207

RefSeq (білок)


NP_001128143 NP_001317530 NP_077271 NP_001350892


NP_077169

Локус (UCSC)

Хр. 8: 123.01 – 123.04 Mb

Хр. 15: 57.73 – 57.76 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

DERL1 (англ. Derlin 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 251 амінокислот, а молекулярна маса — 28 801^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSDIGDWFRS	IPAITRYWFA	ATVAVPLVGK	LGLISPAYLF	LWPEAFLYRF
QIWRPITATF	YFPVGPGTGF	LYLVNLYFLY	QYSTRLETGA	FDGRPADYLF
MLLFNWICIV	ITGLAMDMQL	LMIPLIMSVL	YVWAQLNRDM	IVSFWFGTRF
KACYLPWVIL	GFNYIIGGSV	INELIGNLVG	HLYFFLMFRY	PMDLGGRNFL
STPQFLYRWL	PSRRGGVSGF	GVPPASMRRA	ADQNGGGGRH	NWGQGFRLGD
Q

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як взаємодія хазяїн-вірус, транспорт, транспорт білків, відповідь на порушення конформації білку, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у мембрані, ендоплазматичному ретикулумі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Lilley B.N., Ploegh H.L. (2004). A membrane protein required for dislocation of misfolded proteins from the ER. Nature. 429: 834—840. PMID 15215855 DOI:10.1038/nature02592
Ye Y., Shibata Y., Yun C., Ron D., Rapoport T.A. (2004). A membrane protein complex mediates retro-translocation from the ER lumen into the cytosol. Nature. 429: 841—847. PMID 15215856 DOI:10.1038/nature02656
Katiyar S., Joshi S., Lennarz W.J. (2005). The retrotranslocation protein derlin-1 binds peptide:N-glycanase to the endoplasmic reticulum. Mol. Biol. Cell. 16: 4584—4594. PMID 16055502 DOI:10.1091/mbc.E05-04-0345
Lilley B.N., Ploegh H.L. (2005). Multiprotein complexes that link dislocation, ubiquitination, and extraction of misfolded proteins from the endoplasmic reticulum membrane. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 102: 14296—14301. PMID 16186509 DOI:10.1073/pnas.0505014102
Maruyama Y., Yamada M., Takahashi K., Yamada M. (2008). Ubiquitin ligase Kf-1 is involved in the endoplasmic reticulum-associated degradation pathway. Biochem. Biophys. Res. Commun. 374: 737—741. PMID 18675248 DOI:10.1016/j.bbrc.2008.07.126

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:28454 (англ.) . Процитовано 7 вересня 2017.
↑ UniProt, Q9BUN8 (англ.) . Архів оригіналу за 17 серпня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.