FGD3

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2COC

Ідентифікатори

Символи

FGD3, ZFYVE5, FYVE, RhoGEF and PH domain containing 3

Зовнішні ІД

OMIM: 617554 MGI: 1353657 HomoloGene: 22925 GeneCards: FGD3

Онтологія гена
Молекулярна функція	• зв'язування з іоном металу • small GTPase binding • guanyl-nucleotide exchange factor activity
Клітинна компонента	• цитоплазма • гіалоплазма • комплекс Ґольджі • ruffle • цитоскелет • lamellipodium
Біологічний процес	• GO:0043087, GO:0032313, GO:0032319, GO:0032314, GO:0043088 regulation of GTPase activity • filopodium assembly • cytoskeleton organization • regulation of cell shape • positive regulation of apoptotic process • regulation of Rho protein signal transduction • regulation of small GTPase mediated signal transduction • actin cytoskeleton organization • G protein-coupled receptor signaling pathway
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


89846


30938

Ensembl


ENSG00000127084


ENSMUSG00000037946

UniProt


Q5JSP0


O88842

RefSeq (мРНК)


NM_001083536 NM_001286993 NM_033086 NM_001369951 NM_001369952


NM_015759

RefSeq (білок)

NP_001077005 NP_001273922 NP_149077 NP_001356880 NP_001356881
NP_001077005.1 NP_149077.2


н/д

Локус (UCSC)

Хр. 9: 92.95 – 93.04 Mb

Хр. 13: 49.42 – 49.47 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

FGD3 (англ. FYVE, RhoGEF and PH domain containing 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 725 амінокислот, а молекулярна маса — 79 401^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MESGRGSSTP	PGPIAALGMP	DTGPGSSSLG	KLQALPVGPR	AHCGDPVSLA
AAGDGSPDIG	PTGELSGSLK	IPNRDSGIDS	PSSSVAGENF	PCEEGLEAGP
SPTVLGAHAE	MALDSQVPKV	TPQEEADSDV	GEEPDSENTP	QKADKDAGLA
QHSGPQKLLH	IAQELLHTEE	TYVKRLHLLD	QVFCTRLTDA	GIPPEVIMGI
FSNISSIHRF	HGQFLLPELK	TRITEEWDTN	PRLGDILQKL	APFLKMYGEY
VKNFDRAVGL	VSTWTQRSPL	FKDVVHSIQK	QEVCGNLTLQ	HHMLEPVQRV
PRYELLLKDY	LKRLPQDAPD	RKDAERSLEL	ISTAANHSNA	AIRKVEKMHK
LLEVYEQLGG	EEDIVNPANE	LIKEGQIQKL	SAKNGTPQDR	HLFLFNSMIL
YCVPKLRLMG	QKFSVREKMD	ISGLQVQDIV	KPNTAHTFII	TGRKRSLELQ
TRTEEEKKEW	IQIIQATIEK	HKQNSETFKA	FGGAFSQDED	PSLSPDMPIT
STSPVEPVVT	TEGSSGAAGL	EPRKLSSKTR	RDKEKQSCKS	CGETFNSITK
RRHHCKLCGA	VICGKCSEFK	AENSRQSRVC	RDCFLTQPVA	PESTEKTPTA
DPQPSLLCGP	LRLSESGETW	SEVWAAIPMS	DPQVLHLQGG	SQDGRLPRTI
PLPSCKLSVP	DPEERLDSGH	VWKLQWAKQS	WYLSASSAEL	QQQWLETLST
AAHGDTAQDS	PGALQLQVPM	GAAAP

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:16027 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.
↑ UniProt, Q5JSP0 (англ.) . Архів оригіналу за 22 липня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.