NOD2

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
5IRL, 5IRM, 5IRN

Ідентифікатори

Символи

NOD2, ACUG, BLAU, CARD15, CD, CLR16.3, IBD1, NLRC2, NOD2B, PSORAS1, nucleotide binding oligomerization domain containing 2, BLAUS, YAOS

Зовнішні ІД

OMIM: 605956 MGI: 2429397 HomoloGene: 11156 GeneCards: NOD2

Пов'язані генетичні захворювання

Хвороба Крона, запальні захворювання кишківника, Blau syndrome, ентерит, неспецифічний виразковий коліт^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• Hsp90 protein binding • nucleotide binding • Hsp70 protein binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • peptidoglycan binding • enzyme binding • actin binding • CARD domain binding • ATP binding • protein kinase binding • muramyl dipeptide binding • GO:0032403 protein-containing complex binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • гіалоплазма • везикула • мембрана • клітинна мембрана • cell surface • basolateral plasma membrane • COP9 signalosome • цитоскелет • комплекс Ґольджі • мітохондрія • GO:0009327 protein-containing complex
Біологічний процес	• positive regulation of prostaglandin-endoperoxide synthase activity • regulation of apoptotic process • defense response • detection of biotic stimulus • cytokine production involved in immune response • positive regulation of cytokine production involved in inflammatory response • GO:0007243 intracellular signal transduction • detection of muramyl dipeptide • positive regulation of interleukin-10 production • positive regulation of epithelial cell proliferation • процес імунної системи • GO:1900490 positive regulation of oxidoreductase activity • response to muramyl dipeptide • positive regulation of prostaglandin-E synthase activity • positive regulation of JNK cascade • positive regulation of nitric-oxide synthase biosynthetic process • positive regulation of NIK/NF-kappaB signaling • positive regulation of phosphatidylinositol 3-kinase activity • positive regulation of gamma-delta T cell activation • cellular response to muramyl dipeptide • JNK cascade • negative regulation of macrophage apoptotic process • positive regulation of dendritic cell antigen processing and presentation • nucleotide-binding oligomerization domain containing 2 signaling pathway • maintenance of gastrointestinal epithelium • defense response to bacterium • positive regulation of NF-kappaB transcription factor activity • positive regulation of interleukin-8 production • detection of bacterium • positive regulation of interleukin-1 beta production • regulation of inflammatory response • positive regulation of interleukin-6 production • protein complex oligomerization • positive regulation of tumor necrosis factor production • positive regulation of ERK1 and ERK2 cascade • positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling • positive regulation of B cell activation • positive regulation of interleukin-17 production • positive regulation of type 2 immune response • nucleotide-binding oligomerization domain containing signaling pathway • positive regulation of stress-activated MAPK cascade • positive regulation of Notch signaling pathway • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:1904579 cellular response to organic cyclic compound • positive regulation of cell population proliferation • вроджений імунітет • response to nutrient • positive regulation of dendritic cell cytokine production • positive regulation of protein K63-linked ubiquitination • cellular response to peptidoglycan • positive regulation of MAP kinase activity • interleukin-1-mediated signaling pathway • cellular response to lipopolysaccharide
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


64127


257632

Ensembl


ENSG00000167207


ENSMUSG00000055994

UniProt


Q9HC29


Q80SY9

RefSeq (мРНК)


NM_001293557 NM_022162 NM_001370466


NM_145857

RefSeq (білок)


NP_001280486 NP_071445 NP_001357395


NP_665856

Локус (UCSC)

Хр. 16: 50.69 – 50.73 Mb

Хр. 8: 89.37 – 89.42 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

NOD2 (англ. Nucleotide binding oligomerization domain containing 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 040 амінокислот, а молекулярна маса — 115 283^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MGEEGGSASH	DEEERASVLL	GHSPGCEMCS	QEAFQAQRSQ	LVELLVSGSL
EGFESVLDWL	LSWEVLSWED	YEGFHLLGQP	LSHLARRLLD	TVWNKGTWAC
QKLIAAAQEA	QADSQSPKLH	GCWDPHSLHP	ARDLQSHRPA	IVRRLHSHVE
NMLDLAWERG	FVSQYECDEI	RLPIFTPSQR	ARRLLDLATV	KANGLAAFLL
QHVQELPVPL	ALPLEAATCK	KYMAKLRTTV	SAQSRFLSTY	DGAETLCLED
IYTENVLEVW	ADVGMAGPPQ	KSPATLGLEE	LFSTPGHLND	DADTVLVVGE
AGSGKSTLLQ	RLHLLWAAGQ	DFQEFLFVFP	FSCRQLQCMA	KPLSVRTLLF
EHCCWPDVGQ	EDIFQLLLDH	PDRVLLTFDG	FDEFKFRFTD	RERHCSPTDP
TSVQTLLFNL	LQGNLLKNAR	KVVTSRPAAV	SAFLRKYIRT	EFNLKGFSEQ
GIELYLRKRH	HEPGVADRLI	RLLQETSALH	GLCHLPVFSW	MVSKCHQELL
LQEGGSPKTT	TDMYLLILQH	FLLHATPPDS	ASQGLGPSLL	RGRLPTLLHL
GRLALWGLGM	CCYVFSAQQL	QAAQVSPDDI	SLGFLVRAKG	VVPGSTAPLE
FLHITFQCFF	AAFYLALSAD	VPPALLRHLF	NCGRPGNSPM	ARLLPTMCIQ
ASEGKDSSVA	ALLQKAEPHN	LQITAAFLAG	LLSREHWGLL	AECQTSEKAL
LRRQACARWC	LARSLRKHFH	SIPPAAPGEA	KSVHAMPGFI	WLIRSLYEMQ
EERLARKAAR	GLNVGHLKLT	FCSVGPTECA	ALAFVLQHLR	RPVALQLDYN
SVGDIGVEQL	LPCLGVCKAL	YLRDNNISDR	GICKLIECAL	HCEQLQKLAL
FNNKLTDGCA	HSMAKLLACR	QNFLALRLGN	NYITAAGAQV	LAEGLRGNTS
LQFLGFWGNR	VGDEGAQALA	EALGDHQSLR	WLSLVGNNIG	SVGAQALALM
LAKNVMLEEL	CLEENHLQDE	GVCSLAEGLK	KNSSLKILKL	SNNCITYLGA
EALLQALERN	DTILEVWLRG	NTFSLEEVDK	LGCRDTRLLL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як імунітет, вроджений імунітет. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, мембрані.

Література

Lee K.H., Biswas A., Liu Y.J., Kobayashi K.S. (2012). Proteasomal degradation of Nod2 protein mediates tolerance to bacterial cell wall components. J. Biol. Chem. 287: 39800—39811. PMID 23019338 DOI:10.1074/jbc.M112.410027
Menning M., Kufer T.A. (2013). A role for the Ankyrin repeat containing protein Ankrd17 in Nod1- and Nod2-mediated inflammatory responses. FEBS Lett. 587: 2137—2142. PMID 23711367 DOI:10.1016/j.febslet.2013.05.037
Parkhouse R., Boyle J.P., Monie T.P. (2014). Blau syndrome polymorphisms in NOD2 identify nucleotide hydrolysis and helical domain 1 as signalling regulators. FEBS Lett. 588: 3382—3389. PMID 25093298 DOI:10.1016/j.febslet.2014.07.029
Mohanan V., Grimes C.L. (2014). The molecular chaperone HSP70 binds to and stabilizes NOD2, an important protein involved in Crohn disease. J. Biol. Chem. 289: 18987—18998. PMID 24790089 DOI:10.1074/jbc.M114.557686
Milman N., Ursin K., Rodevand E., Nielsen F.C., Hansen T.V. (2009). A novel mutation in the NOD2 gene associated with Blau syndrome: a Norwegian family with four affected members. Scand. J. Rheumatol. 38: 190—197. PMID 19169908 DOI:10.1080/03009740802464194
Zeybek C., Basbozkurt G., Gul D., Demirkaya E., Gok F. (2015). A new mutation in blau syndrome. Case Rep. Rheumatol. 2015: 463959—463959. PMID 25692065 DOI:10.1155/2015/463959

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з NOD2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:5331 (англ.) . Архів оригіналу за 21 квітня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.
↑ UniProt, Q9HC29 (англ.) . Архів оригіналу за 18 жовтня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.