PDE5A

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
4OEX, 1RKP, 1T9R, 1T9S, 1TBF, 1UDT, 1UDU, 1UHO, 1XOZ, 1XP0, 2CHM, 2H40, 2H42, 2H44, 2XSS, 3B2R, 3BJC, 3HC8, 3HDZ, 3JWQ, 3JWR, 3LFV, 3MF0, 3SHY, 3SHZ, 3SIE, 3TGE, 3TGG, 4G2W, 4G2Y, 4I9Z, 4IA0, 4MD6, 4OEW

Ідентифікатори

Символи

PDE5A, CGB-PDE, CN5A, PDE5, phosphodiesterase 5A

Зовнішні ІД

OMIM: 603310 MGI: 2651499 HomoloGene: 842 GeneCards: PDE5A

шифр КФ

3.1.4.35

Реагує на сполуку

ібуділаст, Мілринон, SCH-51866, силденафіл, тадалафіл, варденафіл, zaprinast, силденафіл, ібуділаст, gisadenafil^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• nucleotide binding • 3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase activity • cGMP binding • зв'язування з іоном металу • cyclic-nucleotide phosphodiesterase activity • каталітична активність • phosphoric diester hydrolase activity • hydrolase activity • 3',5'-cyclic-GMP phosphodiesterase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding
Клітинна компонента	• гіалоплазма • компонент клітини
Біологічний процес	• positive regulation of MAP kinase activity • cGMP metabolic process • positive regulation of cardiac muscle hypertrophy • cGMP catabolic process • negative regulation of T cell proliferation • positive regulation of oocyte development • обмін речовин • relaxation of cardiac muscle • GO:0072468 сигнальна трансдукція • negative regulation of cardiac muscle contraction • regulation of nitric oxide mediated signal transduction
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


8654


242202

Ensembl


ENSG00000138735


ENSMUSG00000053965

UniProt


O76074


Q8CG03

RefSeq (мРНК)


NM_033437 NM_001083 NM_033430


NM_153422

RefSeq (білок)


NP_001074 NP_236914 NP_246273


NP_700471

Локус (UCSC)

Хр. 4: 119.49 – 119.63 Mb

Хр. 3: 122.52 – 122.65 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

PDE5A (англ. Phosphodiesterase 5A) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. ^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 875 амінокислот, а молекулярна маса — 99 985^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MERAGPSFGQ	QRQQQQPQQQ	KQQQRDQDSV	EAWLDDHWDF	TFSYFVRKAT
REMVNAWFAE	RVHTIPVCKE	GIRGHTESCS	CPLQQSPRAD	NSAPGTPTRK
ISASEFDRPL	RPIVVKDSEG	TVSFLSDSEK	KEQMPLTPPR	FDHDEGDQCS
RLLELVKDIS	SHLDVTALCH	KIFLHIHGLI	SADRYSLFLV	CEDSSNDKFL
ISRLFDVAEG	STLEEVSNNC	IRLEWNKGIV	GHVAALGEPL	NIKDAYEDPR
FNAEVDQITG	YKTQSILCMP	IKNHREEVVG	VAQAINKKSG	NGGTFTEKDE
KDFAAYLAFC	GIVLHNAQLY	ETSLLENKRN	QVLLDLASLI	FEEQQSLEVI
LKKIAATIIS	FMQVQKCTIF	IVDEDCSDSF	SSVFHMECEE	LEKSSDTLTR
EHDANKINYM	YAQYVKNTME	PLNIPDVSKD	KRFPWTTENT	GNVNQQCIRS
LLCTPIKNGK	KNKVIGVCQL	VNKMEENTGK	VKPFNRNDEQ	FLEAFVIFCG
LGIQNTQMYE	AVERAMAKQM	VTLEVLSYHA	SAAEEETREL	QSLAAAVVPS
AQTLKITDFS	FSDFELSDLE	TALCTIRMFT	DLNLVQNFQM	KHEVLCRWIL
SVKKNYRKNV	AYHNWRHAFN	TAQCMFAALK	AGKIQNKLTD	LEILALLIAA
LSHDLDHRGV	NNSYIQRSEH	PLAQLYCHSI	MEHHHFDQCL	MILNSPGNQI
LSGLSIEEYK	TTLKIIKQAI	LATDLALYIK	RRGEFFELIR	KNQFNLEDPH
QKELFLAMLM	TACDLSAITK	PWPIQQRIAE	LVATEFFDQG	DRERKELNIE
PTDLMNREKK	NKIPSMQVGF	IDAICLQLYE	ALTHVSEDCF	PLLDGCRKNR
QKWQALAEQQ	EKMLINGESG	QAKRN

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з нуклеотидами, іонами металів.

Література

Stacey P., Rulten S., Dapling A., Phillips S.C. (1998). Molecular cloning and expression of human cGMP-binding cGMP-specific phosphodiesterase. Biochem. Biophys. Res. Commun. 247: 249—254. PMID 9642111 DOI:10.1006/bbrc.1998.8769
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Rybalkin S.D., Rybalkina I.G., Feil R., Hofmann F., Beavo J.A. (2002). Regulation of cGMP-specific phosphodiesterase (PDE5) phosphorylation in smooth muscle cells. J. Biol. Chem. 277: 3310—3317. PMID 11723116 DOI:10.1074/jbc.M106562200
Zhou L., Thompson W.J., Potter D.E. (1999). Multiple cyclic nucleotide phosphodiesterases in human trabecular meshwork cells. Invest. Ophthalmol. Vis. Sci. 40: 1745—1752. PMID 10393044

Примітки

↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з PDE5A переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:8784 (англ.) . Процитовано 30 серпня 2017.
↑ UniProt, O76074 (англ.) . Архів оригіналу за 16 вересня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.