PTP4A1

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1RXD, 1XM2

Ідентифікатори

Символи

PTP4A1, HH72, PRL-1, PRL1, PTP(CAAX1), PTPCAAX1, protein tyrosine phosphatase type IVA, member 1, protein tyrosine phosphatase 4A1

Зовнішні ІД

OMIM: 601585 MGI: 1277096 HomoloGene: 2587 GeneCards: PTP4A1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• phosphoprotein phosphatase activity • GO:0098519, GO:0098518 phosphatase activity • protein tyrosine phosphatase activity • hydrolase activity • protein tyrosine/serine/threonine phosphatase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • ендосома • мембрана • клітинна мембрана • веретено поділу • early endosome • ендоплазматичний ретикулум • cytoplasmic side of plasma membrane • цитоскелет • клітинне ядро
Біологічний процес	• positive regulation of cell migration • GO:0016576 protein dephosphorylation • multicellular organism development • клітинний цикл • GO:0098501, GO:0098502, GO:0006286 дефосфорилювання • peptidyl-tyrosine dephosphorylation
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


7803


19243

Ensembl


ENSG00000112245


ENSMUSG00000026064

UniProt


Q93096


Q63739

RefSeq (мРНК)


NM_003463


NM_011200

RefSeq (білок)


NP_003454


NP_035330

Локус (UCSC)

Хр. 6: 63.52 – 63.58 Mb

н/д

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

PTP4A1 (англ. Protein tyrosine phosphatase type IVA, member 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 173 амінокислот, а молекулярна маса — 19 815^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MARMNRPAPV	EVTYKNMRFL	ITHNPTNATL	NKFIEELKKY	GVTTIVRVCE
ATYDTTLVEK	EGIHVLDWPF	DDGAPPSNQI	VDDWLSLVKI	KFREEPGCCI
AVHCVAGLGR	APVLVALALI	EGGMKYEDAV	QFIRQKRRGA	FNSKQLLYLE
KYRPKMRLRF	KDSNGHRNNC	CIQ

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеїн-фосфатаз, білків розвитку. Задіяний у такому біологічному процесі, як клітинний цикл. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, цитоскелеті, мембрані, ендоплазматичному ретикулумі, ендосомах.

Література

Peng Y., Genin A., Spinner N.B., Diamond R.H., Taub R. (1998). The gene encoding human nuclear protein tyrosine phosphatase, PRL-1. Cloning, chromosomal localization, and identification of an intron enhancer. J. Biol. Chem. 273: 17286—17295. PMID 9642300 DOI:10.1074/jbc.273.27.17286
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Wang J., Kirby C.E., Herbst R. (2002). The tyrosine phosphatase PRL-1 localizes to the endoplasmic reticulum and the mitotic spindle and is required for normal mitosis. J. Biol. Chem. 277: 46659—46668. PMID 12235145 DOI:10.1074/jbc.M206407200
Raghavendra Prasad H.S., Qi Z., Srinivasan K.N., Gopalakrishnakone P. (2004). Potential effects of tetrodotoxin exposure to human glial cells postulated using microarray approach. Toxicon. 44: 597—608. PMID 15501285 DOI:10.1016/j.toxicon.2004.07.018
Dayton M.A., Knobloch T.J. (1997). Multiple phosphotyrosine phosphatase mRNAs are expressed in the human lung fibroblast cell line WI-38. Recept. Signal Transduct. 7: 241—256. PMID 9633825

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9634 (англ.) . Процитовано 6 вересня 2017.
↑ UniProt, Q93096 (англ.) . Архів оригіналу за 5 червня 2016. Процитовано 6 вересня 2017.