RBM14

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2DNP

Ідентифікатори

Символи

RBM14, COAA, PSP2, SIP, SYTIP1, TMEM137, RNA binding motif protein 14

Зовнішні ІД

OMIM: 612409 MGI: 1929092 HomoloGene: 4614 GeneCards: RBM14

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein-macromolecule adaptor activity • GO:0001104 transcription coregulator activity • nuclear receptor coactivator activity • nucleic acid binding • RNA binding
Клітинна компонента	• ядерце • mediator complex • transcription regulator complex • цитоплазма • клітинне ядро • nuclear speck • нуклеоплазма • Рибонуклеопротеїни
Біологічний процес	• glucocorticoid receptor signaling pathway • response to hormone • SMAD protein signal transduction • DNA recombination • GO:0100026 Репарація ДНК • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • реплікація ДНК • intracellular estrogen receptor signaling pathway • transcription, DNA-templated • negative regulation of centriole replication • histone deacetylation • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • centriole assembly • activation of innate immune response • процес імунної системи • вроджений імунітет
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


10432


56275

Ensembl


ENSG00000239306


ENSMUSG00000006456

UniProt


Q96PK6


Q8C2Q3

RefSeq (мРНК)


NM_032886 NM_001198836 NM_001198837 NM_006328


NM_019869

RefSeq (білок)


NP_001185765 NP_001185766 NP_006319


NP_063922

Локус (UCSC)

Хр. 11: 66.62 – 66.63 Mb

Хр. 19: 4.85 – 4.86 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

RBM14 (англ. RNA binding motif protein 14) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 669 амінокислот, а молекулярна маса — 69 492^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MKIFVGNVDG	ADTTPEELAA	LFAPYGTVMS	CAVMKQFAFV	HMRENAGALR
AIEALHGHEL	RPGRALVVEM	SRPRPLNTWK	IFVGNVSAAC	TSQELRSLFE
RRGRVIECDV	VKDYAFVHME	KEADAKAAIA	QLNGKEVKGK	RINVELSTKG
QKKGPGLAVQ	SGDKTKKPGA	GDTAFPGTGG	FSATFDYQQA	FGNSTGGFDG
QARQPTPPFF	GRDRSPLRRS	PPRASYVAPL	TAQPATYRAQ	PSVSLGAAYR
AQPSASLGVG	YRTQPMTAQA	ASYRAQPSVS	LGAPYRGQLA	SPSSQSAAAS
SLGPYGGAQP	SASALSSYGG	QAAAASSLNS	YGAQGSSLAS	YGNQPSSYGA
QAASSYGVRA	AASSYNTQGA	ASSLGSYGAQ	AASYGAQSAA	SSLAYGAQAA
SYNAQPSASY	NAQSAPYAAQ	QAASYSSQPA	AYVAQPATAA	AYASQPAAYA
AQATTPMAGS	YGAQPVVQTQ	LNSYGAQASM	GLSGSYGAQS	AAAATGSYGA
AAAYGAQPSA	TLAAPYRTQS	SASLAASYAA	QQHPQAAASY	RGQPGNAYDG
AGQPSAAYLS	MSQGAVANAN	STPPPYERTR	LSPPRASYDD	PYKKAVAMSK
RYGSDRRLAE	LSDYRRLSES	QLSFRRSPTK	SSLDYRRLPD	AHSDYARYSG
SYNDYLRAAQ	MHSGYQRRM

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до репресорів. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

Iwasaki T., Chin W.W., Ko L. (2001). Identification and characterization of RRM-containing coactivator activator (CoAA) as TRBP-interacting protein, and its splice variant as a coactivator modulator (CoAM). J. Biol. Chem. 276: 33375—33383. PMID 11443112 DOI:10.1074/jbc.M101517200
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Iwasaki T., Koibuchi N., Chin W.W. (2005). Synovial sarcoma translocation (SYT) encodes a nuclear receptor coactivator. Endocrinology. 146: 3892—3899. PMID 15919756 DOI:10.1210/en.2004-1513
Carrascal M., Ovelleiro D., Casas V., Gay M., Abian J. (2008). Phosphorylation analysis of primary human T lymphocytes using sequential IMAC and titanium oxide enrichment. J. Proteome Res. 7: 5167—5176. PMID 19367720 DOI:10.1021/pr800500r
Ahmad Y., Boisvert F.M., Lundberg E., Uhlen M., Lamond A.I. (2012). Systematic analysis of protein pools, isoforms, and modifications affecting turnover and subcellular localization. Mol. Cell. Proteomics. 11: M111.013680.01 — M111.013680.15. PMID 22002106 DOI:10.1074/mcp.M111.013680
Shiratsuchi G., Takaoka K., Ashikawa T., Hamada H., Kitagawa D. (2015). RBM14 prevents assembly of centriolar protein complexes and maintains mitotic spindle integrity. EMBO J. 34: 97—114. PMID 25385835 DOI:10.15252/embj.201488979

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:14219 (англ.) . Архів оригіналу за 11 вересня 2015. Процитовано 21 серпня 2017.
↑ UniProt, Q96PK6 (англ.) . Архів оригіналу за 9 серпня 2017. Процитовано 21 серпня 2017.