S100A8 |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/4/4e/Protein_S100A8_PDB_1mr8.png/250px-Protein_S100A8_PDB_1mr8.png) |
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 1MR8, 1XK4, 4GGF, 4XJK, 5HLO, 5HLV | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | S100A8, 60B8AG, CAGA, CFAG, CGLA, CP-10, L1Ag, MA387, MIF, MRP8, NIF, P8, S100 calcium binding protein A8, S100-A8 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 123885 MGI: 88244 HomoloGene: 2225 GeneCards: S100A8 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • Toll-like receptor 4 binding • RAGE receptor binding • microtubule binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • calcium ion binding • arachidonic acid binding • zinc ion binding • зв'язування з іоном металу |
---|
Клітинна компонента | • клітинне ядро • цитоскелет • гіалоплазма • екзосома • мембрана • клітинна мембрана • цитоплазма • міжклітинний простір • secretory granule lumen • intermediate filament cytoskeleton • extracellular region • collagen-containing extracellular matrix |
---|
Біологічний процес | • regulation of inflammatory response • activation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process • процес імунної системи • positive regulation of inflammatory response • neutrophil chemotaxis • positive regulation of intrinsic apoptotic signaling pathway • defense response to fungus • response to ethanol • chemokine production • response to zinc ion • acute inflammatory response • defense response to bacterium • leukocyte migration involved in inflammatory response • peptidyl-cysteine S-nitrosylation • sequestering of zinc ion • neutrophil aggregation • response to lipopolysaccharide • хемотаксис • positive regulation of peptide secretion • chronic inflammatory response • astrocyte development • Загоєння ран • GO:0097285 апоптоз • positive regulation of cell growth • автофагія • inflammatory response • regulation of cytoskeleton organization • GO:0032617 cytokine production • positive regulation of NF-kappaB transcription factor activity • вроджений імунітет • toll-like receptor signaling pathway • antimicrobial humoral response • neutrophil degranulation • autocrine signaling |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/b/b4/PBB_GE_S100A8_202917_s_at_fs.png/250px-PBB_GE_S100A8_202917_s_at_fs.png) |
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_002964 NM_001319196 NM_001319197 NM_001319198 NM_001319201 |
| |
---|
RefSeq (білок) | | NP_001306125 NP_001306126 NP_001306127 NP_001306130 NP_002955 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 1: 153.39 – 153.39 Mb | Хр. 3: 90.58 – 90.58 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
S100A8 (англ. S100 calcium binding protein A8) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 93 амінокислот, а молекулярна маса — 10 835[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MLTELEKALN | | SIIDVYHKYS | | LIKGNFHAVY | | RDDLKKLLET | | ECPQYIRKKG |
ADVWFKELDI | | NTDGAVNFQE | | FLILVIKMGV | | AAHKKSHEES | | HKE |
Кодований геном білок за функцією належить до антимікробних білків. Задіяний у таких біологічних процесах як апоптоз, імунітет, вроджений імунітет, запальна відповідь, хемотаксис, автофагія. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, цитоскелеті, мембрані. Також секретований назовні.
Література
- Lagasse E., Clerc R.G. (1988). Cloning and expression of two human genes encoding calcium-binding proteins that are regulated during myeloid differentiation. Mol. Cell. Biol. 8: 2402—2410. PMID 3405210 DOI:10.1128/MCB.8.6.2402
- Schaefer T., Sachse G.E., Gassen H.G. (1991). The calcium-binding protein MRP-8 is produced by human pulmonary tumor cells. Biol. Chem. Hoppe-Seyler. 372: 1—4. PMID 2039599 DOI:10.1515/bchm3.1991.372.1.1
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Marti T., Erttmann K.D., Gallin M.Y. (1996). Host-parasite interaction in human onchocerciasis: identification and sequence analysis of a novel human calgranulin. Biochem. Biophys. Res. Commun. 221: 454—458. PMID 8619876 DOI:10.1006/bbrc.1996.0616
- Miyasaki K.T., Bodeau A.L., Murthy A.R., Lehrer R.I. (1993). In vitro antimicrobial activity of the human neutrophil cytosolic S-100 protein complex, calprotectin, against Capnocytophaga sputigena. J. Dent. Res. 72: 517—523. PMID 8423249 DOI:10.1177/00220345930720020801
- Ryckman C., Vandal K., Rouleau P., Talbot M., Tessier P.A. (2003). Proinflammatory activities of S100: proteins S100A8, S100A9, and S100A8/A9 induce neutrophil chemotaxis and adhesion. J. Immunol. 170: 3233—3242. PMID 12626582 DOI:10.4049/jimmunol.170.6.3233
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10498 (англ.) . Архів оригіналу за 23 вересня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.
- ↑ UniProt, P05109 (англ.) . Архів оригіналу за 16 грудня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.
Див. також
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |