SEC23A

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2NUP, 2NUT, 2YRC, 2YRD, 3EFO, 3EG9, 3EGD, 3EGX

Ідентифікатори

Символи

SEC23A, CLSD, Sec23 homolog A, coat complex II component, hSec23A, Sec23 homolog A, COPII coat complex component

Зовнішні ІД

OMIM: 610511 MGI: 1349635 HomoloGene: 4642 GeneCards: SEC23A

Пов'язані генетичні захворювання

cranio–lenticulo–sutural dysplasia^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding • zinc ion binding • зв'язування з іоном металу • GO:0005097, GO:0005099, GO:0005100 GTPase activator activity
Клітинна компонента	• мембрана • Golgi membrane • perinuclear region of cytoplasm • COPII-coated ER to Golgi transport vesicle • ендоплазматичний ретикулум • extrinsic component of membrane • COPII vesicle coat • endoplasmic reticulum exit site • цитоплазма • endoplasmic reticulum membrane • гіалоплазма • ER to Golgi transport vesicle membrane • GO:0016023 cytoplasmic vesicle
Біологічний процес	• antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class II • antigen processing and presentation of peptide antigen via MHC class I • endoplasmic reticulum to Golgi vesicle-mediated transport • COPII vesicle coating • protein transport • intracellular protein transport • vesicle-mediated transport • COPII-coated vesicle cargo loading • COPII-coated vesicle budding • regulation of COPII vesicle coating • Golgi organization • regulation of cell shape • macroautophagy • GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity • protein localization to plasma membrane
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


10484


20334

Ensembl


ENSG00000100934


ENSMUSG00000020986

UniProt


Q15436


Q01405

RefSeq (мРНК)


NM_006364


NM_009147 NM_001361956

RefSeq (білок)


NP_006355


NP_033173 NP_001348885

Локус (UCSC)

Хр. 14: 39.03 – 39.11 Mb

Хр. 12: 59.01 – 59.06 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

SEC23A (англ. Sec23 homolog A, coat complex II component) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 14-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 765 амінокислот, а молекулярна маса — 86 161^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MTTYLEFIQQ	NEERDGVRFS	WNVWPSSRLE	ATRMVVPVAA	LFTPLKERPD
LPPIQYEPVL	CSRTTCRAVL	NPLCQVDYRA	KLWACNFCYQ	RNQFPPSYAG
ISELNQPAEL	LPQFSSIEYV	VLRGPQMPLI	FLYVVDTCME	DEDLQALKES
MQMSLSLLPP	TALVGLITFG	RMVQVHELGC	EGISKSYVFR	GTKDLSAKQL
QEMLGLSKVP	LTQATRGPQV	QQPPPSNRFL	QPVQKIDMNL	TDLLGELQRD
PWPVPQGKRP	LRSSGVALSI	AVGLLECTFP	NTGARIMMFI	GGPATQGPGM
VVGDELKTPI	RSWHDIDKDN	AKYVKKGTKH	FEALANRAAT	TGHVIDIYAC
ALDQTGLLEM	KCCPNLTGGY	MVMGDSFNTS	LFKQTFQRVF	TKDMHGQFKM
GFGGTLEIKT	SREIKISGAI	GPCVSLNSKG	PCVSENEIGT	GGTCQWKICG
LSPTTTLAIY	FEVVNQHNAP	IPQGGRGAIQ	FVTQYQHSSG	QRRIRVTTIA
RNWADAQTQI	QNIAASFDQE	AAAILMARLA	IYRAETEEGP	DVLRWLDRQL
IRLCQKFGEY	HKDDPSSFRF	SETFSLYPQF	MFHLRRSSFL	QVFNNSPDES
SYYRHHFMRQ	DLTQSLIMIQ	PILYAYSFSG	PPEPVLLDSS	SILADRILLM
DTFFQILIYH	GETIAQWRKS	GYQDMPEYEN	FRHLLQAPVD	DAQEILHSRF
PMPRYIDTEH	GGSQARFLLS	KVNPSQTHNN	MYAWGQESGA	PILTDDVSLQ
VFMDHLKKLA	VSSAA

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків, транспорт між ендоплазматичним ретикулумом і апаратом Гольджі, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів. Локалізований у цитоплазмі, мембрані, ендоплазматичному ретикулумі, цитоплазматичних везикулах.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Bhattacharyya D., Glick B.S. (2007). Two mammalian Sec16 homologues have nonredundant functions in endoplasmic reticulum (ER) export and transitional ER organization. Mol. Biol. Cell. 18: 839—849. PMID 17192411 DOI:10.1091/mbc.E06-08-0707
Mancias J.D., Goldberg J. (2007). The transport signal on Sec22 for packaging into COPII-coated vesicles is a conformational epitope. Mol. Cell. 26: 403—414. PMID 17499046 DOI:10.1016/j.molcel.2007.03.017
Mancias J.D., Goldberg J. (2008). Structural basis of cargo membrane protein discrimination by the human COPII coat machinery. EMBO J. 27: 2918—2928. PMID 18843296 DOI:10.1038/emboj.2008.208
Ma W., Goldberg J. (2016). TANGO1/cTAGE5 receptor as a polyvalent template for assembly of large COPII coats. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 113: 10061—10066. PMID 27551091 DOI:10.1073/pnas.1605916113

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з SEC23A переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10701 (англ.) . Архів оригіналу за 10 вересня 2015. Процитовано 11 вересня 2017.
↑ UniProt, Q15436 (англ.) . Архів оригіналу за 31 серпня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.