SLC47A1

Ідентифікатори

Символи

SLC47A1, MATE1, solute carrier family 47 member 1

Зовнішні ІД

OMIM: 609832 MGI: 1914723 HomoloGene: 34364 GeneCards: SLC47A1

Реагує на сполуку

Онтологія гена
Молекулярна функція	• antiporter activity • monovalent cation:proton antiporter activity • GO:0015238 xenobiotic transmembrane transporter activity
Клітинна компонента	• integral component of membrane • клітинна мембрана • мембрана • везикула
Біологічний процес	• proton transmembrane transport • трансмембранний транспорт • xenobiotic export • xenobiotic transmembrane transport • organic cation transport • cation transport • xenobiotic transport
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


55244


67473

Ensembl


ENSG00000142494


ENSMUSG00000010122

UniProt


Q96FL8


Q8K0H1

RefSeq (мРНК)


NM_018242


NM_026183

RefSeq (білок)


NP_060712


NP_080459

Локус (UCSC)

Хр. 17: 19.5 – 19.58 Mb

Хр. 11: 61.23 – 61.27 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

SLC47A1 (англ. Solute carrier family 47 member 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 570 амінокислот, а молекулярна маса — 61 922^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MEAPEEPAPV	RGGPEATLEV	RGSRCLRLSA	FREELRALLV	LAGPAFLVQL
MVFLISFISS	VFCGHLGKLE	LDAVTLAIAV	INVTGVSVGF	GLSSACDTLI
SQTYGSQNLK	HVGVILQRSA	LVLLLCCFPC	WALFLNTQHI	LLLFRQDPDV
SRLTQTYVTI	FIPALPATFL	YMLQVKYLLN	QGIVLPQIVT	GVAANLVNAL
ANYLFLHQLH	LGVIGSALAN	LISQYTLALL	LFLYILGKKL	HQATWGGWSL
ECLQDWASFL	RLAIPSMLML	CMEWWAYEVG	SFLSGILGMV	ELGAQSIVYE
LAIIVYMVPA	GFSVAASVRV	GNALGAGDME	QARKSSTVSL	LITVLFAVAF
SVLLLSCKDH	VGYIFTTDRD	IINLVAQVVP	IYAVSHLFEA	LACTSGGVLR
GSGNQKVGAI	VNTIGYYVVG	LPIGIALMFA	TTLGVMGLWS	GIIICTVFQA
VCFLGFIIQL	NWKKACQQAQ	VHANLKVNNV	PRSGNSALPQ	DPLHPGCPEN
LEGILTNDVG	KTGEPQSDQQ	MRQEEPLPEH	PQDGAKLSRK	QLVLRRGLLL
LGVFLILLVG	ILVRFYVRIQ

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Hiasa M., Matsumoto T., Komatsu T., Moriyama Y. (2006). Wide variety of locations for rodent MATE1, a transporter protein that mediates the final excretion step for toxic organic cations. Am. J. Physiol. 291: C678—C686. PMID 16641166 DOI:10.1152/ajpcell.00090.2006
Omote H., Hiasa M., Matsumoto T., Otsuka M., Moriyama Y. (2006). The MATE proteins as fundamental transporters of metabolic and xenobiotic organic cations. Trends Pharmacol. Sci. 27: 587—593. PMID 16996621 DOI:10.1016/j.tips.2006.09.001
Chen Y., Zhang S., Sorani M., Giacomini K.M. (2007). Transport of paraquat by human organic cation transporters and multidrug and toxic compound extrusion family. J. Pharmacol. Exp. Ther. 322: 695—700. PMID 17495125 DOI:10.1124/jpet.107.123554

Примітки

↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з Solute carrier family 47 member 1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:25588 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
↑ UniProt, Q96FL8 (англ.) . Архів оригіналу за 1 серпня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.