USP8 |
---|
![](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/4/40/Protein_USP8_PDB_1whb.png/250px-Protein_USP8_PDB_1whb.png) |
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | Список кодів PDB | 1WHB, 2A9U, 2GFO, 2GWF, 3N3K | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | USP8, HumORF8, SPG59, UBPY, ubiquitin specific peptidase 8, PITA4 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 603158 MGI: 1934029 HomoloGene: 3782 GeneCards: USP8 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • cysteine-type peptidase activity • SH3 domain binding • thiol-dependent deubiquitinase • GO:0070122 peptidase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • cysteine-type endopeptidase activity • hydrolase activity • cadherin binding |
---|
Клітинна компонента | • цитоплазма • ендосома • мембрана • клітинна мембрана • extrinsic component of endosome membrane • midbody • endosome membrane • extrinsic component of plasma membrane • клітинне ядро • GO:0097483, GO:0097481 постсинаптичне ущільнення • dendritic spine • early endosome • гіалоплазма • glutamatergic synapse |
---|
Біологічний процес | • protein K48-linked deubiquitination • ubiquitin-dependent protein catabolic process • mitotic cytokinesis • endosome organization • протеоліз • protein K63-linked deubiquitination • клітинний цикл • проліферація • protein deubiquitination • cellular response to dexamethasone stimulus • cellular response to nerve growth factor stimulus • positive regulation of canonical Wnt signaling pathway • Ras protein signal transduction • regulation of protein stability • regulation of protein localization • regulation of protein catabolic process at postsynapse, modulating synaptic transmission |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_001128610 NM_001128611 NM_001283049 NM_005154 |
| |
---|
RefSeq (білок) | | NP_001122082 NP_001269978 NP_005145 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 15: 50.42 – 50.51 Mb | Хр. 2: 126.55 – 126.6 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
USP8 (англ. Ubiquitin specific peptidase 8) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 15-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 118 амінокислот, а молекулярна маса — 127 523[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MPAVASVPKE | | LYLSSSLKDL | | NKKTEVKPEK | | ISTKSYVHSA | | LKIFKTAEEC |
RLDRDEERAY | | VLYMKYVTVY | | NLIKKRPDFK | | QQQDYFHSIL | | GPGNIKKAVE |
EAERLSESLK | | LRYEEAEVRK | | KLEEKDRQEE | | AQRLQQKRQE | | TGREDGGTLA |
KGSLENVLDS | | KDKTQKSNGE | | KNEKCETKEK | | GAITAKELYT | | MMTDKNISLI |
IMDARRMQDY | | QDSCILHSLS | | VPEEAISPGV | | TASWIEAHLP | | DDSKDTWKKR |
GNVEYVVLLD | | WFSSAKDLQI | | GTTLRSLKDA | | LFKWESKTVL | | RNEPLVLEGG |
YENWLLCYPQ | | YTTNAKVTPP | | PRRQNEEVSI | | SLDFTYPSLE | | ESIPSKPAAQ |
TPPASIEVDE | | NIELISGQNE | | RMGPLNISTP | | VEPVAASKSD | | VSPIIQPVPS |
IKNVPQIDRT | | KKPAVKLPEE | | HRIKSESTNH | | EQQSPQSGKV | | IPDRSTKPVV |
FSPTLMLTDE | | EKARIHAETA | | LLMEKNKQEK | | ELRERQQEEQ | | KEKLRKEEQE |
QKAKKKQEAE | | ENEITEKQQK | | AKEEMEKKES | | EQAKKEDKET | | SAKRGKEITG |
VKRQSKSEHE | | TSDAKKSVED | | RGKRCPTPEI | | QKKSTGDVPH | | TSVTGDSGSG |
KPFKIKGQPE | | SGILRTGTFR | | EDTDDTERNK | | AQREPLTRAR | | SEEMGRIVPG |
LPSGWAKFLD | | PITGTFRYYH | | SPTNTVHMYP | | PEMAPSSAPP | | STPPTHKAKP |
QIPAERDREP | | SKLKRSYSSP | | DITQAIQEEE | | KRKPTVTPTV | | NRENKPTCYP |
KAEISRLSAS | | QIRNLNPVFG | | GSGPALTGLR | | NLGNTCYMNS | | ILQCLCNAPH |
LADYFNRNCY | | QDDINRSNLL | | GHKGEVAEEF | | GIIMKALWTG | | QYRYISPKDF |
KITIGKINDQ | | FAGYSQQDSQ | | ELLLFLMDGL | | HEDLNKADNR | | KRYKEENNDH |
LDDFKAAEHA | | WQKHKQLNES | | IIVALFQGQF | | KSTVQCLTCH | | KKSRTFEAFM |
YLSLPLASTS | | KCTLQDCLRL | | FSKEEKLTDN | | NRFYCSHCRA | | RRDSLKKIEI |
WKLPPVLLVH | | LKRFSYDGRW | | KQKLQTSVDF | | PLENLDLSQY | | VIGPKNNLKK |
YNLFSVSNHY | | GGLDGGHYTA | | YCKNAARQRW | | FKFDDHEVSD | | ISVSSVKSSA |
AYILFYTSLG | | PRVTDVAT |
Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, тіолових протеаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинний цикл, убіквітинування білків, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, ядрі, мембрані, ендосомах.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Row P.E., Prior I.A., McCullough J., Clague M.J., Urbe S. (2006). The ubiquitin isopeptidase UBPY regulates endosomal ubiquitin dynamics and is essential for receptor down-regulation. J. Biol. Chem. 281: 12618—12624. PMID 16520378 DOI:10.1074/jbc.M512615200
- Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
- Pohl C., Jentsch S. (2008). Final stages of cytokinesis and midbody ring formation are controlled by BRUCE. Cell. 132: 832—845. PMID 18329369 DOI:10.1016/j.cell.2008.01.012
- Waters S., Marchbank K., Solomon E., Whitehouse C., Gautel M. (2009). Interactions with LC3 and polyubiquitin chains link nbr1 to autophagic protein turnover. FEBS Lett. 583: 1846—1852. PMID 19427866 DOI:10.1016/j.febslet.2009.04.049
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:12631 (англ.) . Архів оригіналу за 10 вересня 2015. Процитовано 11 вересня 2017.
- ↑ UniProt, P40818 (англ.) . Архів оригіналу за 28 січня 2018. Процитовано 11 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |