ZNF687

Ідентифікатори

Символи

ZNF687, PDB6, zinc finger protein 687

Зовнішні ІД

OMIM: 610568 MGI: 1925516 HomoloGene: 10827 GeneCards: ZNF687

Онтологія гена
Молекулярна функція	• зв'язування з іоном металу • DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • nucleic acid binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента	• клітинне ядро • цитоплазма • нуклеоплазма • гіалоплазма
Біологічний процес	• GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


57592


78266

Ensembl


ENSG00000143373


ENSMUSG00000019338

UniProt


Q8N1G0


Q9D2D7

RefSeq (мРНК)


NM_001304763 NM_001304764 NM_020832


NM_030074 NM_001357863

RefSeq (білок)


NP_001291692 NP_001291693 NP_065883


NP_084350 NP_001344792

Локус (UCSC)

Хр. 1: 151.28 – 151.29 Mb

Хр. 3: 95.01 – 95.02 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

ZNF687 (англ. Zinc finger protein 687) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 237 амінокислот, а молекулярна маса — 129 529^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MGDMKTPDFD	DLLAAFDIPD	IDANEAIHSG	PEENEGPGGP	GKPEPGVGSE
SEDTAAASAG	DGPGVPAQAS	DHGLPPPDIS	VVSVIVKNTV	CPEQSEALAG
GSAGDGAQAA	GVTKEGPVGP	HRMQNGFGSP	EPSLPGTPHS	PAPPSGGTWK
EKGMEGKTPL	DLFAHFGPEP	GDHSDPLPPS	APSPTREGAL	TPPPFPSSFE
LAQENGPGMQ	PPVSSPPLGA	LKQESCSPHH	PQVLAQQGSG	SSPKATDIPA
SASPPPVAGV	PFFKQSPGHQ	SPLASPKVPV	CQPLKEEDDD	EGPVDKSSPG
SPQSPSSGAE	AADEDSNDSP	ASSSSRPLKV	RIKTIKTSCG	NITRTVTQVP
SDPDPPAPLA	EGAFLAEASL	LKLSPATPTS	EGPKVVSVQL	GDGTRLKGTV
LPVATIQNAS	TAMLMAASVA	RKAVVLPGGT	ATSPKMIAKN	VLGLVPQALP
KADGRAGLGT	GGQKVNGASV	VMVQPSKTAT	GPSTGGGTVI	SRTQSSLVEA
FNKILNSKNL	LPAYRPNLSP	PAEAGLALPP	TGYRCLECGD	AFSLEKSLAR
HYDRRSMRIE	VTCNHCARRL	VFFNKCSLLL	HAREHKDKGL	VMQCSHLVMR
PVALDQMVGQ	PDITPLLPVA	VPPVSGPLAL	PALGKGEGAI	TSSAITTVAA
EAPVLPLSTE	PPAAPATSAY	TCFRCLECKE	QCRDKAGMAA	HFQQLGPPAP
GATSNVCPTC	PMMLPNRCSF	SAHQRMHKNR	PPHVCPECGG	NFLQANFQTH
LREACLHVSR	RVGYRCPSCS	VVFGGVNSIK	SHIQTSHCEV	FHKCPICPMA
FKSGPSAHAH	LYSQHPSFQT	QQAKLIYKCA	MCDTVFTHKP	LLSSHFDQHL
LPQRVSVFKC	PSCPLLFAQK	RTMLEHLKNT	HQSGRLEETA	GKGAGGALLT
PKTEPEELAV	SQGGAAPATE	ESSSSSEEEE	VPSSPEPPRP	AKRPRRELGS
KGLKGGGGGP	GGWTCGLCHS	WFPERDEYVA	HMKKEHGKSV	KKFPCRLCER
SFCSAPSLRR	HVRVNHEGIK	RVYPCRYCTE	GKRTFSSRLI	LEKHVQVRHG
LQLGAQSPGR	GTTLARGSSA	RAQGPGRKRR	QSSDSCSEEP	DSTTPPAKSP
RGGPGSGGHG	PLRYRSSSST	EQSLMMGLRV	EDGAQQCLDC	GLCFASPGSL
SRHRFISHKK	RRGVGKASAL	GLGDGEEEAP	PSRSDPDGGD	SPLPASGGPL
TCKVCGKSCD	SPLNLKTHFR	THGMAFIRAR	QGAVGDN

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

Nagase T., Kikuno R., Ishikawa K., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVI. The complete sequences of 150 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 65—73. PMID 10718198 DOI:10.1093/dnares/7.1.65
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Hendriks I.A., Treffers L.W., Verlaan-de Vries M., Olsen J.V., Vertegaal A.C. (2015). SUMO-2 orchestrates chromatin modifiers in response to DNA damage. Cell Rep. 10: 1778—1791. PMID 25772364 DOI:10.1016/j.celrep.2015.02.033

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:29277 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.
↑ UniProt, Q8N1G0 (англ.) . Архів оригіналу за 20 грудня 2016. Процитовано 28 серпня 2017.