Gliceraldehid-3-fosfat dehidrogenaza

Gliceraldehid-3-fosfat dehidrogenaza
GAPDH sa NAD+ i Pi vezanim za aktivno mesto. PDB prikaz baziran na 2CZC​.
Dostupne strukture
1U8F​, 1ZNQ​, 3GPD
Identifikatori
Simboli GAPDH; G3PD; GAPD
Vanjski ID OMIM: 138400 MGI: 3646088 HomoloGene: 107053 GeneCards: GAPDH Gene
EC broj 1.2.1.12
Ontologija gena
Molekularna funkcija aktivnost gliceraldehid-3-fosfat dehidrogenaza (NAD+) (fosforilacija)
proteinsko vezivanje
Celularna komponenta jedro
citoplazma
lipidna čestica
citosol
Biološki proces organizacija mikrotubularnog citoskeletona
karbohidratni metabolički proces
glukozni metabolički proces
Pregled RNK izražavanja
podaci
Ortolozi
Vrsta Čovek Miš
Entrez 2597 100043349
Ensembl ENSG00000111640 ENSMUSG00000078370
UniProt P04406 P16858
RefSeq (mRNA) NM_001256799.1 NM_008084
RefSeq (protein) NP_001243728.1 NP_001074766
Lokacija (UCSC) Chr 12:
6.64 - 6.65 Mb
Chr 12:
71.02 - 71.02 Mb
PubMed pretraga [1] [2]

Gliceraldehid-3-fosfat dehidrogenaza (GAPDH, G3PDH) (EC 1.2.1.12) je enzim sa masom od ~37 kDa, koji katalizuje šesti korak glikolize i stoga doprinosi procesu razlaganja glukoze radi oslobađanja energije. GAPDH učestvuje u nekoliko nemetaboličkih procesa, uključujući aktivaciju transkripcije, inicijaciju apoptoze,[1] i druge.

Metabolička funkcija

Gliceraldehid 3-fosfat dehidrogenaza (GAPDH) katalizuje konverziju gliceraldehid 3-fosfata do D-glicerat 1,3-bisfosfata.

Reakcija

gliceraldehid 3-fosfat gliceraldehid fosfat dehidrogenaza D-glicerat 1,3-bisfosfat
 
NAD+ + Pi NADH + H+
NAD+ + Pi NADH + H+
 
 

Јedinjenje C00118 u KEGG Metabolički put bazi podataka. Enzim 1.2.1.12 u KEGG Metabolički put bazi podataka. Reakcija R01063 u KEGG Metabolički Put bazi podataka. Јedinjenje C00236 u KEGG Metabolički put bazi podataka.

Reference

  1. ^ A. Tarze; A. Deniaud; M. Le Bras; E. Maillier; D. Molle; N. Larochette; N. Zamzami; G. Jan; G. Kroemer & C. Brenner (2007). „GAPDH, a novel regulator of the pro-apoptotic mitochondrial membrane permeabilization”. Oncogene. 26 (18): 2606—2620. PMID 17072346. doi:10.1038/sj.onc.1210074. 

Literatura

  • Donald Voet; Judith G. Voet (2005). Biochemistry (3 изд.). Wiley. ISBN 9780471193500. 
  • Stryer, Lubert; Berg, Jeremy Mark; Tymoczko, John L. (2002). Biochemistry, Fifth Edition & Lecture Notebook. San Francisco: W. H. Freeman. 
  • Diagram of the GAPDH reaction mechanism from Lodish MCB at NCBI bookshelf
  • Similar diagram from Alberts The Cell at NCBI bookshelf
  • Nicholas C. Price; Lewis Stevens (1999). Fundamentals of Enzymology: The Cell and Molecular Biology of Catalytic Proteins (Third изд.). USA: Oxford University Press. ISBN 019850229X. 
  • Eric J. Toone (2006). Advances in Enzymology and Related Areas of Molecular Biology, Protein Evolution (Volume 75 изд.). Wiley-Interscience. ISBN 0471205036. 
  • Branden C; Tooze J. Introduction to Protein Structure. New York, NY: Garland Publishing. ISBN 0-8153-2305-0. 
  • Irwin H. Segel. Enzyme Kinetics: Behavior and Analysis of Rapid Equilibrium and Steady-State Enzyme Systems (Book 44 изд.). Wiley Classics Library. ISBN 0471303097. 
  • William P. Jencks (1987). Catalysis in Chemistry and Enzymology. Dover Publications. ISBN 0486654605. 

Spoljašnje veze

  • п
  • р
  • у
PDB Galerija
  • 1j0x​: Krostalna struktura gliceraldehid-3-fosfat dehidrogenaze (GAPDH) iz mišiča zeca
    1j0x: Krostalna struktura gliceraldehid-3-fosfat dehidrogenaze (GAPDH) iz mišiča zeca
  • 1u8f​: Krostalna struktura ljudske materične gliceraldehid-3-fosfat dehidrogenaze na 1,75 A
    1u8f: Krostalna struktura ljudske materične gliceraldehid-3-fosfat dehidrogenaze na 1,75 A
  • 1znq​: Krostalna struktura ljudske jetrene GAPDH
    1znq: Krostalna struktura ljudske jetrene GAPDH
  • п
  • р
  • у
Glikoliza
Glukoneogeneza
to oksaloacetat:
iz laktata (Korijev ciklus):
iz alanina (Alaninski ciklus):
iz glicerola:
Regulatorni
  • п
  • р
  • у
Aldehid/Okso oksidoreduktaze (EC 1.2)
1.2.1: NAD ili NADP
1.2.2: citohrom
  • Format dehidrogenaza (citohrom)
1.2.3: kiseonik
1.2.4: disulfid
  • Oksoglutarat dehidrogenazni kompleks
  • Piruvatna dehidrogenaza
  • Dehidrogenazni kompleks alfa-keto kiseline razgranatog lanca
    • BCKDHA
    • BCKDHB
    • DBT
    • DLD
1.2.7: gvožđe-sumporni protein
  • п
  • р
  • у
Teme
Tipovi
  • B enzm: 1.1/2/3/4/5/6/7/8/10/11/13/14/15-18, 2.1/2/3/4/5/6/7/8, 2.7.10, 2.7.11-12, 3.1/2/3/4/5/6/7, 3.1.3.48, 3.4.21/22/23/24, 4.1/2/3/4/5/6, 5.1/2/3/4/99, 6.1-3/4/5-6
Portali:
  •  Molekularna i ćelijska biologija
  •  Hemija