CLCA2

Ідентифікатори

Символи

CLCA2, CACC, CACC3, CLCRG2, CaCC-3, chloride channel accessory 2

Зовнішні ІД

OMIM: 604003 MGI: 2139758 HomoloGene: 4765 GeneCards: CLCA2

Онтологія гена
Молекулярна функція	• зв'язування з іоном металу • GO:0070122 peptidase activity • ligand-gated ion channel activity • hydrolase activity • metallopeptidase activity • chloride channel activity • metalloendopeptidase activity • intracellular calcium activated chloride channel activity
Клітинна компонента	• integral component of membrane • мембрана • integral component of plasma membrane • extracellular region • міжклітинні контакти • basal plasma membrane • клітинне ядро • гіалоплазма • клітинна мембрана • Ядерна мембрана
Біологічний процес	• chloride transmembrane transport • ion transport • протеоліз • адгезія клітин • chloride transport • ion transmembrane transport
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


9635


229933

Ensembl


ENSG00000137975


ENSMUSG00000036960

UniProt


Q9UQC9


Q8BG22

RefSeq (мРНК)


NM_006536


NM_178697

RefSeq (білок)


NP_006527


NP_848812

Локус (UCSC)

Хр. 1: 86.42 – 86.46 Mb

Хр. 3: 144.78 – 144.81 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

CLCA2 (англ. Chloride channel accessory 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 943 амінокислот, а молекулярна маса — 103 941^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MTQRSIAGPI	CNLKFVTLLV	ALSSELPFLG	AGVQLQDNGY	NGLLIAINPQ
VPENQNLISN	IKEMITEASF	YLFNATKRRV	FFRNIKILIP	ATWKANNNSK
IKQESYEKAN	VIVTDWYGAH	GDDPYTLQYR	GCGKEGKYIH	FTPNFLLNDN
LTAGYGSRGR	VFVHEWAHLR	WGVFDEYNND	KPFYINGQNQ	IKVTRCSSDI
TGIFVCEKGP	CPQENCIISK	LFKEGCTFIY	NSTQNATASI	MFMQSLSSVV
EFCNASTHNQ	EAPNLQNQMC	SLRSAWDVIT	DSADFHHSFP	MNGTELPPPP
TFSLVQAGDK	VVCLVLDVSS	KMAEADRLLQ	LQQAAEFYLM	QIVEIHTFVG
IASFDSKGEI	RAQLHQINSN	DDRKLLVSYL	PTTVSAKTDI	SICSGLKKGF
EVVEKLNGKA	YGSVMILVTS	GDDKLLGNCL	PTVLSSGSTI	HSIALGSSAA
PNLEELSRLT	GGLKFFVPDI	SNSNSMIDAF	SRISSGTGDI	FQQHIQLEST
GENVKPHHQL	KNTVTVDNTV	GNDTMFLVTW	QASGPPEIIL	FDPDGRKYYT
NNFITNLTFR	TASLWIPGTA	KPGHWTYTLN	NTHHSLQALK	VTVTSRASNS
AVPPATVEAF	VERDSLHFPH	PVMIYANVKQ	GFYPILNATV	TATVEPETGD
PVTLRLLDDG	AGADVIKNDG	IYSRYFFSFA	ANGRYSLKVH	VNHSPSISTP
AHSIPGSHAM	YVPGYTANGN	IQMNAPRKSV	GRNEEERKWG	FSRVSSGGSF
SVLGVPAGPH	PDVFPPCKII	DLEAVKVEEE	LTLSWTAPGE	DFDQGQATSY
EIRMSKSLQN	IQDDFNNAIL	VNTSKRNPQQ	AGIREIFTFS	PQISTNGPEH
QPNGETHESH	RIYVAIRAMD	RNSLQSAVSN	IAQAPLFIPP	NSDPVPARDY
LILKGVLTAM	GLIGIICLII	VVTHHTLSRK	KRADKKENGT	KLL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, металопротеаз. Задіяний у таких біологічних процесах як клітинна адгезія, транспорт іонів, транспорт, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, іоном кальцію, хлоридом. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних контактах. Також секретований назовні.

Література

Agnel M., Vermat T., Culouscou J.-M. (1999). Identification of three novel members of the calcium-dependent chloride channel (CaCC) family predominantly expressed in the digestive tract and trachea. FEBS Lett. 455: 295—301. PMID 10437792 DOI:10.1016/S0014-5793(99)00891-1
Itoh R., Kawamoto S., Miyamoto Y., Kinoshita S., Okubo K. (2000). Isolation and characterization of a Ca(2+)-activated chloride channel from human corneal epithelium. Curr. Eye Res. 21: 918—925. PMID 11262615 DOI:10.1076/ceyr.21.6.918.6983
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Bustin S.A., Li S.-R., Dorudi S. (2001). Expression of the Ca2+-activated chloride channel genes CLCA1 and CLCA2 is downregulated in human colorectal cancer. DNA Cell Biol. 20: 331—338. PMID 11445004 DOI:10.1089/10445490152122442
Abdel-Ghany M., Cheng H.-C., Elble R.C., Pauli B.U. (2001). The breast cancer beta 4 integrin and endothelial human CLCA2 mediate lung metastasis. J. Biol. Chem. 276: 25438—25446. PMID 11320086 DOI:10.1074/jbc.M100478200
Connon C.J., Kawasaki S., Yamasaki K., Quantock A.J., Kinoshita S. (2005). The quantification of hCLCA2 and colocalisation with integrin beta4 in stratified human epithelia. Acta Histochem. 106: 421—425. PMID 15707651 DOI:10.1016/j.acthis.2004.08.003

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2016 (англ.) . Архів оригіналу за 11 березня 2016. Процитовано 28 серпня 2017.
↑ UniProt, Q9UQC9 (англ.) . Архів оригіналу за 20 жовтня 2016. Процитовано 28 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 1

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

Іонні канали

Ca²⁺: Кальцієві канали

Ліганд-залежні	Інозитолтрифосфатні 1 2 3 ріанодинові 1 2 3

Потенціалкеровані	L-тип/Ca_vα 1.1 1.2 1.3 1.4 N-тип/Ca_vα2.2 P-тип/Ca_vα 1 Q-тип/Ca_vα2.1 R-тип/Ca_vα2.3 1 T-тип/Ca_vα 3.1 3.2 3.3 α₂δ-субодиниці 1 2 β-компоненти β1 β2 β3 β4 γ-компоненти γ1 γ2 γ3 γ4 CATSPER 1 2 3 4 TPC 1 2

Na⁺: Натрієві канали

постійно відчинені	Епітеліальні α β γ δ

Протончутливі	Кислота 1 2 3 4

Потенціалкеровані	Na_vα 1.1 1.2 1.3 1.4 1.5 1.6 1.7 1.8 1.9 7A Na_vβ 1 2 3 4

K⁺: Калієві канали

Кальцій-активовані	BK α1 β1 β2 β3 β4 SK SK1 SK2 SK3 IK channel IK1 K_Ca 1.1 2.1 2.2 2.3 3.1 4.1 4.2 5.1

Вхідного випрямлення	K_АТФ K_ir 1.1 2.1 2.2 2.3 2.4 2.6 GIRK/K_ir 3.1 3.2 3.3 3.4 K_ir 4.1 4.2 5.1 6.1 6.2 7.1

Двопородоменні	K2P 1 2 3 4 5 6 7 9 10 12 13 15 16 17 18

Потенціалкеровані	K_vα1-6 1.1 1.2 1.3 1.4 1.5 1.6 1.7 1.8 2.1 2.2 3.1 3.2 3.3 3.4 4.1 4.2 4.3 5.1 6.1 6.2 6.3 6.4 K_vα7-12 7.1 7.2 7.3 7.4 7.5 8.1 8.2 9.1 9.2 9.3 10.1 10.2 11.1 11.2 11.3 12.1 12.2 12.3 K_vβ 1 2 3 KCNIP 1 2 3 4 minK/ISK minK/ISK-подібний MiRP 1 2 3

Різні

Cl⁻: Хлорні канали	Кальцій-активовані Аноктамін ANO1 Бестрофін 1 2 CLCA 1 2 3 4 CFTR CLCN 1 2 3 4 5 6 7 KA KB CLIC 1 2 3 4 5 6 L1 CLNS 1A 1B

H⁺: Протонні канали	HVCN1

M⁺: CNG-канали	α 1 2 3 4 β 1 2 3 HCN FC 1 2 3 4

M⁺: TRP-канали	TRPA 1 TRPC 1 2 3 4 4AP 5 6 7 TRPM 1 2 3 4 5 6 7 8 TRPML 1 2 3 TRPN TRPP 1 2 TRPV 1 2 3 4 5 6

H₂O (+ розчини): Порини	Аквапорини 0 1 2 3 4 5 6 7 8 9 VDAC 1 2 3

Цитоплазма: Щілинні контакти	Коннексин A GJA1 GJA3 GJA4 GJA5 GJA8 GJA9 GJA10 B GJB1 GJB2 GJB3 GJB4 GJB5 GJB6 GJB7 C GJC1 GJC2 GJC3 D GJD2 GJD3 GJD4 Іннексин

За механізмом залежності

Ion channel class	Лігандкеровані Світлокеровані Потенціалкеровані Механічно-активовані