FCRL5

FCRL5
Идентификаторы
ПсевдонимыFCRL5, BXMAS1, CD307, CD307e, FCRH5, IRTA2, PRO820, Fc receptor like 5
Внешние IDOMIM: 605877 MGI: 3053558 HomoloGene: 137404 GeneCards: FCRL5
Расположение гена (человек)
1-я хромосома человека
Хр.1-я хромосома человека[1]
1-я хромосома человека
Расположение в геноме FCRL5
Расположение в геноме FCRL5
Локус1q23.1Начало157,513,377 bp[1]
Конец157,552,515 bp[1]
Расположение гена (Мышь)
3-я хромосома мыши
Хр.3-я хромосома мыши[2]
3-я хромосома мыши
Расположение в геноме FCRL5
Расположение в геноме FCRL5
Локус3|3 F1Начало87,343,080 bp[2]
Конец87,407,985 bp[2]
Паттерн экспрессии РНК
Bgee
ЧеловекМышь (ортолог)
    н/д
    н/д
BioGPS
н/д
Ортологи
ВидЧеловекМышь
Entrez

83416

329693

Ensembl

ENSG00000143297

ENSMUSG00000048031

UniProt

Q96RD9

Q68SN8

RefSeq (мРНК)

NM_001195388
NM_031281

NM_001113238
NM_183222

RefSeq (белок)

NP_001182317
NP_112571

NP_001106709
NP_899045

Локус (UCSC)Chr 1: 157.51 – 157.55 MbChr 3: 87.34 – 87.41 Mb
Поиск по PubMedИскать[3]Искать[4]
Логотип Викиданных Информация в Викиданных
Смотреть (человек)Смотреть (мышь)

FCRL5 (англ. Fc receptor-like protein 5, Fc-рецептор-подобный белок, тип 5; CD307) — мембранный белок. Продукт гена человека FCRL5[5][6][7].

Функции

FCRL5 участвует в клеточной дифференцировке В-лимфоцитов, иммунном ответе и, возможно, в развитии В-клеточных опухолей.

Структура

Белок FCRL5 состоит из 977 аминокислот, содержит один трансмембранный домен. Молекулярная масса 100 кДа. Внеклеточный участок содержит 1 участок гликозилирования и 8 дисульфидных связей.

Тканевая локализция

Белок экспрессирован на B-клетках маргинальной зоны, иммунобластах, центроцитах герминального центра миндалин и во внутриэпителиальных и межфолликулярных зонах миндалин. Выявляется на многих клетках лимфомы. Изоформы 1, 3, 4 и 5 обнаруживается в лимфатических узлах, селезёнке, костном мозге и тонком кишечнике, причём превалирует 3-я изоформа. Экспрессирован на зрелых В-клетках и на В-клетках памяти.

Примечания

  1. 1 2 3 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000143297 - Ensembl, May 2017
  2. 1 2 3 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000048031 - Ensembl, May 2017
  3. Ссылка на публикацию человека на PubMed:  (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. Ссылка на публикацию мыши на PubMed:  (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. Nakayama Y., Iwamoto Y., Maher S.E., Tanaka Y., Bothwell A.L. Altered gene expression upon BCR cross-linking in Burkitt's lymphoma B cell line (англ.) // Biochem Biophys Res Commun[англ.] : journal. — 2000. — December (vol. 277, no. 1). — P. 124—127. — doi:10.1006/bbrc.2000.3639. — PMID 11027651.
  6. Hatzivassiliou G., Miller I., Takizawa J., Palanisamy N., Rao P.H., Iida S., Tagawa S., Taniwaki M., Russo J., Neri A., Cattoretti G., Clynes R., Mendelsohn C., Chaganti R.S., Dalla-Favera R. IRTA1 and IRTA2, novel immunoglobulin superfamily receptors expressed in B cells and involved in chromosome 1q21 abnormalities in B cell malignancy (англ.) // Immunity : journal. — Cell Press, 2001. — April (vol. 14, no. 3). — P. 277—289. — doi:10.1016/S1074-7613(01)00109-1. — PMID 11290337.
  7. Entrez Gene: FCRL5 Fc receptor-like 5  (неопр.).

Литература

  • Nakayama Y., Weissman S.M., Bothwell A.L. BXMAS1 identifies a cluster of homologous genes differentially expressed in B cells. (англ.) // Biochem. Biophys. Res. Commun.[англ.] : journal. — 2001. — Vol. 285, no. 3. — P. 830—837. — doi:10.1006/bbrc.2001.5231. — PMID 11453668.
  • Davis R.S., Wang Y.H., Kubagawa H., Cooper M.D. Identification of a family of Fc receptor homologs with preferential B cell expression (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 2001. — Vol. 98, no. 17. — P. 9772—9777. — doi:10.1073/pnas.171308498. — PMID 11493702. — PMC 55528.
  • Miller I., Hatzivassiliou G., Cattoretti G. et al. IRTAs: a new family of immunoglobulinlike receptors differentially expressed in B cells (англ.) // Blood[англ.] : journal. — American Society of Hematology[англ.], 2002. — Vol. 99, no. 8. — P. 2662—2669. — doi:10.1182/blood.V99.8.2662. — PMID 11929751.
  • Strausberg R.L., Feingold E.A., Grouse L.H. et al. Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 2003. — Vol. 99, no. 26. — P. 16899—16903. — doi:10.1073/pnas.242603899. — PMID 12477932. — PMC 139241.
  • Clark H.F., Gurney A.L., Abaya E. et al. The Secreted Protein Discovery Initiative (SPDI), a Large-Scale Effort to Identify Novel Human Secreted and Transmembrane Proteins: A Bioinformatics Assessment (англ.) // Genome Res.[англ.] : journal. — 2003. — Vol. 13, no. 10. — P. 2265—2270. — doi:10.1101/gr.1293003. — PMID 12975309. — PMC 403697.
  • Gerhard D.S., Wagner L., Feingold E.A. et al. The Status, Quality, and Expansion of the NIH Full-Length cDNA Project: The Mammalian Gene Collection (MGC) (англ.) // Genome Res.[англ.] : journal. — 2004. — Vol. 14, no. 10B. — P. 2121—2127. — doi:10.1101/gr.2596504. — PMID 15489334. — PMC 528928.
  • Ise T., Maeda H., Santora K. et al. Immunoglobulin superfamily receptor translocation associated 2 protein on lymphoma cell lines and hairy cell leukemia cells detected by novel monoclonal antibodies (англ.) // Clin. Cancer Res.[англ.] : journal. — 2005. — Vol. 11, no. 1. — P. 87—96. — PMID 15671532.
  • Mohan J., Dement-Brown J., Maier S. et al. Epstein-Barr virus nuclear antigen 2 induces FcRH5 expression through CBF1 (англ.) // Blood[англ.] : journal. — American Society of Hematology[англ.], 2006. — Vol. 107, no. 11. — P. 4433—4439. — doi:10.1182/blood-2005-09-3815. — PMID 16439682.
  • Ise T., Kreitman R.J., Pastan I., Nagata S. Sandwich ELISAs for soluble immunoglobulin superfamily receptor translocation-associated 2 (IRTA2)/FcRH5 (CD307) proteins in human sera (англ.) // Clin. Chem. Lab. Med.[англ.] : journal. — 2006. — Vol. 44, no. 5. — P. 594—602. — doi:10.1515/CCLM.2006.115. — PMID 16681430.
  • Gregory S.G., Barlow K.F., McLay K.E. et al. The DNA sequence and biological annotation of human chromosome 1 (англ.) // Nature : journal. — 2006. — Vol. 441, no. 7091. — P. 315—321. — doi:10.1038/nature04727. — PMID 16710414.
  • Taylor A.I., Gould H.J., Sutton B.J., Calvert R.A. The first avian Ig-like Fc receptor family member combines features of mammalian FcR and FCRL (англ.) // Immunogenetics : journal. — 2007. — Vol. 59, no. 4. — P. 323—328. — doi:10.1007/s00251-007-0195-9. — PMID 17273841.
Перейти к шаблону «Кластеры дифференцировки»
1-50
51-100
101-150
151-200
201-250
251-300
301-350
351-400