Рибосомний білок S13

Рибосомний білок S13
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

4UG0, 4V6X, 5A2Q, 5AJ0, 4KZY, 3J7R, 4D61, 4KZX, 4D5L, 5FLX, 4UJD, 3J7P, 4KZZ, 4UJE, 4UJC

Ідентифікатори
Символи RPS13, S13, ribosomal protein S13
Зовнішні ІД OMIM: 180476 MGI: 1915302 HomoloGene: 128182 GeneCards: RPS13
Онтологія гена
Молекулярна функція

• small ribosomal subunit rRNA binding
• structural constituent of ribosome
• GO:0001948, GO:0016582 protein binding
• mRNA binding
• 5.8S rRNA binding
• RNA binding
• mRNA 5'-UTR binding

Клітинна компонента

• гіалоплазма
• рибосома
• мембрана
• focal adhesion
• внутрішньоклітинний
• cytosolic small ribosomal subunit
• ядерце
• екзосома
• клітинне ядро
• нуклеоплазма
• GO:0005578 Позаклітинна матриця
• GO:0097483, GO:0097481 постсинаптичне ущільнення

Біологічний процес

• viral transcription
• SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane
• translational initiation
• nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay
• negative regulation of RNA splicing
• Біосинтез білків
• rRNA processing

Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
6207
68052
Ensembl
ENSG00000110700
ENSMUSG00000090862
UniProt
P62277
P62301
RefSeq (мРНК)
NM_001017
NM_026533
RefSeq (білок)
NP_001008
NP_080809
Локус (UCSC) Хр. 11: 17.07 – 17.08 Mb Хр. 7: 115.93 – 115.93 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

Рибосомний білок S13 (англ. Ribosomal protein S13) – білок, який кодується геном RPS13, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 151 амінокислот, а молекулярна маса — 17 222[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MGRMHAPGKGLSQSALPYRRSVPTWLKLTSDDVKEQIYKLAKKGLTPSQI
GVILRDSHGVAQVRFVTGNKILRILKSKGLAPDLPEDLYHLIKKAVAVRK
HLERNRKDKDAKFRLILIESRIHRLARYYKTKRVLPPNWKYESSTASALV
A

Цей білок за функціями належить до рибонуклеопротеїнів, рибосомних білків.

Література

  • Chadeneau C., Lemoullac B., Denis M.G. (1993). Cloning and analysis of the human S13 ribosomal protein cDNA. Nucleic Acids Res. 21: 2945—2945. PMID 8332508 DOI:10.1093/nar/21.12.2945
  • Kenmochi N., Higa S., Yoshihama M., Tanaka T. (1996). U14 snoRNAs are encoded in introns of human ribosomal protein S13 gene. Biochem. Biophys. Res. Commun. 228: 371—374. PMID 8920921 DOI:10.1006/bbrc.1996.1668
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

  1. ↑ Human PubMed Reference:.
  2. ↑ Mouse PubMed Reference:.
  3. ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10386 (англ.) . Процитовано 6 лютого 2017.
  4. ↑ UniProt, P62277 (англ.) . Процитовано 6 лютого 2017.

Див. також

  • Хромосома 11

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

 
Біосинтез білків: трансляція (трансляція прокаріотів, трансляція еукаріотів)
Білки
Фактори ініціації трансляції
Фактори ініціації трансляції прокаріотів
  • PIF-1
  • PIF-2
  • PIF-3
Фактори ініціації трансляції археїв
  • aIF1
  • aIF2
  • aIF5
  • aIF6
Фактори ініціації трансляції еукаріотів
eIF1
eIF2
eIF3
eIF4
eIF5
eIF6
Фактори елонгації трансляції
Фактори елонгації трансляції прокаріотів
  • EF-Tu
  • EF-Ts
  • EF-G
Фактори елонгації трансляції археїв
  • aEF-1, aEF-2
Фактори елонгації трансляції еукаріотів
Фактори термінації трансляції
  • Фактори термінації трансляції прокаріотів
  • Фактори термінації трансляції археїв
  • Фактори термінації трансляції еукаріотів
Рибосомні білки
Цитоплазмові
підрозділ 60S
підрозділ 40S
Мітохондріальні
підрозділ 39S
підрозділ 28S


Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.