| EIF4B |
|---|
 |
| Наявні структури |
|---|
| PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB |
|---|
| Список кодів PDB | | 1WI8, 2J76 | | |
| Ідентифікатори |
|---|
| Символи | EIF4B, EIF-4B, PRO1843, eukaryotic translation initiation factor 4B |
|---|
| Зовнішні ІД | OMIM: 603928 MGI: 95304 HomoloGene: 83162 GeneCards: EIF4B |
|---|
| Онтологія гена |
|---|
| Молекулярна функція | • GO:0001948, GO:0016582 protein binding
• nucleic acid binding
• ribosomal small subunit binding
• GO:0008026 helicase activity
• RNA strand-exchange activity
• RNA strand annealing activity
• RNA binding
• translation initiation factor activity
|
|---|
| Клітинна компонента | • гіалоплазма
• eukaryotic translation initiation factor 4F complex
• Полісома
|
|---|
| Біологічний процес | • nuclear-transcribed mRNA poly(A) tail shortening
• regulation of translational initiation
• formation of translation preinitiation complex
• eukaryotic translation initiation factor 4F complex assembly
• Біосинтез білків
• translational initiation
• cytoplasmic translation
|
|---|
| Джерела:Amigo / QuickGO | |
| Шаблон експресії |
|---|
 |
| Більше даних |
| Ортологи |
|---|
| Види | Людина | Миша |
|---|
| Entrez | | |
|---|
| Ensembl | | |
|---|
| UniProt | | |
|---|
| RefSeq (мРНК) | | NM_001300821
NM_001417
NM_018507
NM_001330654 |
| |
|---|
| RefSeq (білок) | | NP_001287750
NP_001317583
NP_001408 |
| |
|---|
| Локус (UCSC) | Хр. 12: 53.01 – 53.04 Mb | Хр. 15: 101.98 – 102.01 Mb |
|---|
| PubMed search | [1] | [2] |
|---|
| Вікідані |
| Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
EIF4B (англ. Eukaryotic translation initiation factor 4B) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 611 амінокислот, а молекулярна маса — 69 151[4].
Послідовність амінокислот
| 10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
|---|
| MAASAKKKNK | | KGKTISLTDF | | LAEDGGTGGG | | STYVSKPVSW | | ADETDDLEGD |
| VSTTWHSNDD | | DVYRAPPIDR | | SILPTAPRAA | | REPNIDRSRL | | PKSPPYTAFL |
| GNLPYDVTEE | | SIKEFFRGLN | | ISAVRLPREP | | SNPERLKGFG | | YAEFEDLDSL |
| LSALSLNEES | | LGNRRIRVDV | | ADQAQDKDRD | | DRSFGRDRNR | | DSDKTDTDWR |
| ARPATDSFDD | | YPPRRGDDSF | | GDKYRDRYDS | | DRYRDGYRDG | | YRDGPRRDMD |
| RYGGRDRYDD | | RGSRDYDRGY | | DSRIGSGRRA | | FGSGYRRDDD | | YRGGGDRYED |
| RYDRRDDRSW | | SSRDDYSRDD | | YRRDDRGPPQ | | RPKLNLKPRS | | TPKEDDSSAS |
| TSQSTRAASI | | FGGAKPVDTA | | AREREVEERL | | QKEQEKLQRQ | | LDEPKLERRP |
| RERHPSWRSE | | ETQERERSRT | | GSESSQTGTS | | TTSSRNARRR | | ESEKSLENET |
| LNKEEDCHSP | | TSKPPKPDQP | | LKVMPAPPPK | | ENAWVKRSSN | | PPARSQSSDT |
| EQQSPTSGGG | | KVAPAQPSEE | | GPGRKDENKV | | DGMNAPKGQT | | GNSSRGPGDG |
| GNRDHWKESD | | RKDGKKDQDS | | RSAPEPKKPE | | ENPASKFSSA | | SKYAALSVDG |
| EDENEGEDYA | | E |
Кодований геном білок за функціями належить до факторів ініціації, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як біосинтез білків, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК.
Література
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Methot N., Pause A., Hershey J.W., Sonenberg N. (1994). The translation initiation factor eIF-4B contains an RNA-binding region that is distinct and independent from its ribonucleoprotein consensus sequence. Mol. Cell. Biol. 14: 2307—2316. PMID 8139536 DOI:10.1128/MCB.14.4.2307
- Methot N., Song M.S., Sonenberg N. (1996). A region rich in aspartic acid, arginine, tyrosine, and glycine (DRYG) mediates eukaryotic initiation factor 4B (eIF4B) self-association and interaction with eIF3. Mol. Cell. Biol. 16: 5328—5334. PMID 8816444 DOI:10.1128/MCB.16.10.5328
- Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
- Milburn S.C., Hershey J.W.B., Davies M.V., Kelleher K., Kaufman R.J. (1990). Cloning and expression of eukaryotic initiation factor 4B cDNA: sequence determination identifies a common RNA recognition motif. EMBO J. 9: 2783—2790. PMID 2390971
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:3285 (англ.) . Архів оригіналу за 10 вересня 2015. Процитовано 11 вересня 2017.
- ↑ UniProt, P23588 (англ.) . Архів оригіналу за 31 серпня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.
Див. також
 | Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
 Портал «Біологія»  Портал «Хімія»
|
| |
|---|
| | Білки | | Фактори ініціації трансляції | | Фактори ініціації трансляції прокаріотів | |
|---|
| | Фактори ініціації трансляції археїв | |
|---|
| | Фактори ініціації трансляції еукаріотів | | eIF1 | |
|---|
| | eIF2 | |
|---|
| | eIF3 | |
|---|
| | eIF4 | |
|---|
| | eIF5 | |
|---|
| | eIF6 | |
|---|
|
|---|
|
|---|
| | Фактори елонгації трансляції | | Фактори елонгації трансляції прокаріотів | |
|---|
| | Фактори елонгації трансляції археїв | |
|---|
| | Фактори елонгації трансляції еукаріотів | |
|---|
|
|---|
| | Фактори термінації трансляції | - Фактори термінації трансляції прокаріотів
- Фактори термінації трансляції археїв
- Фактори термінації трансляції еукаріотів
|
|---|
| | Рибосомні білки | | Цитоплазмові | | підрозділ 60S | |
|---|
| | підрозділ 40S | |
|---|
|
|---|
| | Мітохондріальні | | підрозділ 39S | |
|---|
| | підрозділ 28S | |
|---|
|
|---|
|
|---|
|
|---|
|
