| EIF5A |
|---|
 |
| Наявні структури |
|---|
| PDB | Пошук ортологів: I3L397 PDBe I3L397 RCSB |
|---|
| Список кодів PDB | | 3CPF, 5DLQ | | |
| Ідентифікатори |
|---|
| Символи | EIF5A, EIF-5A, EIF5A1, eIF5AI, eukaryotic translation initiation factor 5A, eIF-4D, FABAS |
|---|
| Зовнішні ІД | OMIM: 600187 MGI: 106248 HomoloGene: 133803 GeneCards: EIF5A |
|---|
| Онтологія гена |
|---|
| Молекулярна функція | • protein N-terminus binding
• ribosome binding
• translation elongation factor activity
• GO:0001948, GO:0016582 protein binding
• RNA binding
• U6 snRNA binding
|
|---|
| Клітинна компонента | • цитоплазма
• гіалоплазма
• endoplasmic reticulum membrane
• мембрана
• ядерна пора
• lamellae anulatae
• ендоплазматичний ретикулум
• екзосома
• клітинне ядро
• дендрит (нейробіологія)
• neuronal cell body
|
|---|
| Біологічний процес | • mRNA transport
• Біосинтез білків
• positive regulation of translational elongation
• translational elongation
• mRNA export from nucleus
• peptidyl-lysine modification to peptidyl-hypusine
• nucleocytoplasmic transport
• protein export from nucleus
• positive regulation of cell population proliferation
• protein transport
• translational frameshifting
• positive regulation of translational termination
• GO:0097285 апоптоз
• positive regulation of cytosolic calcium ion concentration
• GO:0010260 старіння людини
• positive regulation of cardiac muscle cell apoptotic process
• positive regulation of apoptotic process
• negative regulation of apoptotic process
• positive regulation of muscle cell differentiation
• cellular response to thyroid hormone stimulus
• positive regulation of reactive oxygen species metabolic process
• GO:0015915 транспорт
|
|---|
| Джерела:Amigo / QuickGO | |
| Шаблон експресії |
|---|
 |
| Більше даних |
| Ортологи |
|---|
| Види | Людина | Миша |
|---|
| Entrez | | |
|---|
| Ensembl | | ENSG00000132507
ENSG00000288145 |
| |
|---|
| UniProt | | |
|---|
| RefSeq (мРНК) | NM_001143760
NM_001143761
NM_001143762
NM_001970
NM_001370420
| | NM_001370421 |
| NM_001166589
NM_001166590
NM_001166591
NM_001166592
NM_001166593
| NM_001166594
NM_001166595
NM_001166596
NM_181582 |
|
|---|
| RefSeq (білок) | NP_001137232
NP_001137233
NP_001137234
NP_001961
NP_001357349
| | NP_001357350 |
| NP_001160061
NP_001160062
NP_001160063
NP_001160064
NP_001160065
| NP_001160066
NP_001160067
NP_001160068
NP_853613 |
|
|---|
| Локус (UCSC) | Хр. 17: 7.31 – 7.31 Mb | Хр. 11: 69.81 – 69.81 Mb |
|---|
| PubMed search | [1] | [2] |
|---|
| Вікідані |
| Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
EIF5A (англ. Eukaryotic translation initiation factor 5A) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 154 амінокислот, а молекулярна маса — 16 832[4].
Послідовність амінокислот
| 10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
|---|
| MADDLDFETG | | DAGASATFPM | | QCSALRKNGF | | VVLKGRPCKI | | VEMSTSKTGK |
| HGHAKVHLVG | | IDIFTGKKYE | | DICPSTHNMD | | VPNIKRNDFQ | | LIGIQDGYLS |
| LLQDSGEVRE | | DLRLPEGDLG | | KEIEQKYDCG | | EEILITVLSA | | MTEEAAVAIK |
| AMAK |
Кодований геном білок за функцією належить до факторів елонгації. Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт, біосинтез білка, транспорт білків, транспорт мРНК, транслокація. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, мембрані, ендоплазматичному ретикулумі, комплексі ядерної пори.
Література
- Koettnitz K., Kappel B., Baumruker T., Hauber J., Bevec D. (1994). The genomic structure encoding human initiation factor eIF-5A. Gene. 144: 249—252. PMID 7545941 DOI:10.1016/0378-1119(94)90385-9
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Lee Y.B., Joe Y.A., Wolff E.C., Dimitriadis E.K., Park M.H. (1999). Complex formation between deoxyhypusine synthase and its protein substrate, the eukaryotic translation initiation factor 5A (eIF5A) precursor. Biochem. J. 340: 273—281. PMID 10229683 DOI:10.1042/bj3400273
- Shi X.-P., Yin K.-C., Zimolo Z.A., Stern A.M., Waxman L. (1996). The subcellular distribution of eukaryotic translation initiation factor, eIF-5A, in cultured cells. Exp. Cell Res. 225: 348—356. PMID 8660923 DOI:10.1006/excr.1996.0185
- Xu A., Jao D.L., Chen K.Y. (2004). Identification of mRNA that binds to eukaryotic initiation factor 5A by affinity co-purification and differential display. Biochem. J. 384: 585—590. PMID 15303967 DOI:10.1042/BJ20041232
- Clement P.M.J., Johansson H.E., Wolff E.C., Park M.H. (2006). Differential expression of eIF5A-1 and eIF5A-2 in human cancer cells. FEBS J. 273: 1102—1114. PMID 16519677 DOI:10.1111/j.1742-4658.2006.05135.x
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:3300 (англ.) . Архів оригіналу за 7 квітня 2016. Процитовано 6 лютого 2017.
- ↑ UniProt, P63241 (англ.) . Архів оригіналу за 2 лютого 2017. Процитовано 6 лютого 2017.
Див. також
 Портал «Біологія»  Портал «Хімія»
|
| |
|---|
| | Білки | | Фактори ініціації трансляції | | Фактори ініціації трансляції прокаріотів | |
|---|
| | Фактори ініціації трансляції археїв | |
|---|
| | Фактори ініціації трансляції еукаріотів | | eIF1 | |
|---|
| | eIF2 | |
|---|
| | eIF3 | |
|---|
| | eIF4 | |
|---|
| | eIF5 | |
|---|
| | eIF6 | |
|---|
|
|---|
|
|---|
| | Фактори елонгації трансляції | | Фактори елонгації трансляції прокаріотів | |
|---|
| | Фактори елонгації трансляції археїв | |
|---|
| | Фактори елонгації трансляції еукаріотів | |
|---|
|
|---|
| | Фактори термінації трансляції | - Фактори термінації трансляції прокаріотів
- Фактори термінації трансляції археїв
- Фактори термінації трансляції еукаріотів
|
|---|
| | Рибосомні білки | | Цитоплазмові | | підрозділ 60S | |
|---|
| | підрозділ 40S | |
|---|
|
|---|
| | Мітохондріальні | | підрозділ 39S | |
|---|
| | підрозділ 28S | |
|---|
|
|---|
|
|---|
|
|---|
|
 | Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
