| EEF1D |
|---|
|
| Наявні структури |
|---|
| PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB |
|---|
| Список кодів PDB | | 2MVM, 2MVN, 2N51 | | |
| Ідентифікатори |
|---|
| Символи | EEF1D, EF-1D, EF1D, FP1047, eukaryotic translation elongation factor 1 delta |
|---|
| Зовнішні ІД | OMIM: 130592 MGI: 1913906 HomoloGene: 23404 GeneCards: EEF1D |
|---|
| Онтологія гена |
|---|
| Молекулярна функція | • DNA binding
• heat shock protein binding
• translation factor activity, RNA binding
• signal transducer activity
• translation elongation factor activity
• GO:0001948, GO:0016582 protein binding
• cadherin binding
|
|---|
| Клітинна компонента | • цитоплазма
• ендоплазматичний ретикулум
• клітинне ядро
• eukaryotic translation elongation factor 1 complex
• fibrillar center
• гіалоплазма
|
|---|
| Біологічний процес | • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated
• regulation of cell death
• translational elongation
• mRNA transcription
• transcription, DNA-templated
• cellular response to ionizing radiation
• positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling
• GO:0072468 сигнальна трансдукція
• Біосинтез білків
|
|---|
| Джерела:Amigo / QuickGO | |
| Шаблон експресії |
|---|
 |
| Більше даних |
| Ортологи |
|---|
| Види | Людина | Миша |
|---|
| Entrez | | |
|---|
| Ensembl | | ENSG00000104529
ENSG00000273594 |
| |
|---|
| UniProt | | |
|---|
| RefSeq (мРНК) | NM_001130053
NM_001130054
NM_001130055
NM_001130056
NM_001130057
| NM_001195203
NM_001289950
NM_001960
NM_032378
NM_001317743
NM_001330646 |
| NM_001285429
NM_001285430
NM_001285431
NM_001285432
NM_001285433
| NM_001285434
NM_023240
NM_029663 |
|
|---|
| RefSeq (білок) | NP_001123525
NP_001123527
NP_001123528
NP_001123529
NP_001182132
| NP_001276879
NP_001304672
NP_001317575
NP_001951
NP_115754 |
| NP_001272358
NP_001272359
NP_001272360
NP_001272361
NP_001272362
| NP_001272363
NP_075729
NP_083939 |
|
|---|
| Локус (UCSC) | Хр. 8: 143.58 – 143.6 Mb | Хр. 15: 75.77 – 75.78 Mb |
|---|
| PubMed search | [1] | [2] |
|---|
| Вікідані |
| Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
EEF1D (англ. Eukaryotic translation elongation factor 1 delta) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 281 амінокислот, а молекулярна маса — 31 122[4].
Послідовність амінокислот
| 10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
|---|
| MATNFLAHEK | | IWFDKFKYDD | | AERRFYEQMN | | GPVAGASRQE | | NGASVILRDI |
| ARARENIQKS | | LAGSSGPGAS | | SGTSGDHGEL | | VVRIASLEVE | | NQSLRGVVQE |
| LQQAISKLEA | | RLNVLEKSSP | | GHRATAPQTQ | | HVSPMRQVEP | | PAKKPATPAE |
| DDEDDDIDLF | | GSDNEEEDKE | | AAQLREERLR | | QYAEKKAKKP | | ALVAKSSILL |
| DVKPWDDETD | | MAQLEACVRS | | IQLDGLVWGA | | SKLVPVGYGI | | RKLQIQCVVE |
| DDKVGTDLLE | | EEITKFEEHV | | QSVDIAAFNK | | I |
Кодований геном білок за функціями належить до факторів елонгації, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, біосинтез білка, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.
Література
- Sanders J.P., Raggiaschi R., Morales J., Moeller W. (1993). The human leucine zipper-containing guanine-nucleotide exchange protein elongation factor-1 delta. Biochim. Biophys. Acta. 1174: 87—90. PMID 8334168 DOI:10.1016/0167-4781(93)90097-W
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Chacko G., Ling Q., Hajjar K.A. (1998). Induction of acute translational response genes by homocysteine. Elongation factors-1alpha, -beta, and -delta. J. Biol. Chem. 273: 19840—19846. PMID 9677419 DOI:10.1074/jbc.273.31.19840
- Beranova-Giorgianni S., Zhao Y., Desiderio D.M., Giorgianni F. (2006). Phosphoproteomic analysis of the human pituitary. Pituitary. 9: 109—120. PMID 16807684 DOI:10.1007/s11102-006-8916-x
- Giorgianni F., Zhao Y., Desiderio D.M., Beranova-Giorgianni S. (2007). Toward a global characterization of the phosphoproteome in prostate cancer cells: identification of phosphoproteins in the LNCaP cell line. Electrophoresis. 28: 2027—2034. PMID 17487921 DOI:10.1002/elps.200600782
- Carrascal M., Ovelleiro D., Casas V., Gay M., Abian J. (2008). Phosphorylation analysis of primary human T lymphocytes using sequential IMAC and titanium oxide enrichment. J. Proteome Res. 7: 5167—5176. PMID 19367720 DOI:10.1021/pr800500r
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:3211 (англ.) . Процитовано 7 вересня 2017.
- ↑ UniProt, P29692 (англ.) . Архів оригіналу за 12 січня 2018. Процитовано 7 вересня 2017.
Див. також
 Портал «Біологія»  Портал «Хімія»
|
| |
|---|
| | Білки | | Фактори ініціації трансляції | | Фактори ініціації трансляції прокаріотів | |
|---|
| | Фактори ініціації трансляції археїв | |
|---|
| | Фактори ініціації трансляції еукаріотів | | eIF1 | |
|---|
| | eIF2 | |
|---|
| | eIF3 | |
|---|
| | eIF4 | |
|---|
| | eIF5 | |
|---|
| | eIF6 | |
|---|
|
|---|
|
|---|
| | Фактори елонгації трансляції | | Фактори елонгації трансляції прокаріотів | |
|---|
| | Фактори елонгації трансляції археїв | |
|---|
| | Фактори елонгації трансляції еукаріотів | |
|---|
|
|---|
| | Фактори термінації трансляції | - Фактори термінації трансляції прокаріотів
- Фактори термінації трансляції археїв
- Фактори термінації трансляції еукаріотів
|
|---|
| | Рибосомні білки | | Цитоплазмові | | підрозділ 60S | |
|---|
| | підрозділ 40S | |
|---|
|
|---|
| | Мітохондріальні | | підрозділ 39S | |
|---|
| | підрозділ 28S | |
|---|
|
|---|
|
|---|
|
|---|
|
 | Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
